Protein–RNA interactions for Protein: Q12516

SRF1, Regulator of phospholipase D SRF1, yeastyeast

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRF1Q12516 PFY1YOR122C 381 nt4.52□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 YKL100CYKL100C 1764 nt4.52□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 NHX1YDR456W 1902 nt4.52□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 YLR177WYLR177W 1887 nt4.52□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 DAP2YHR028C 2457 nt4.51□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 SKP2YNL311C 2292 nt4.51□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 SEC6YIL068C 2418 nt4.51□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 ADK1YDR226W 669 nt4.51□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 RPA12YJR063W 378 nt4.51□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 YPL080CYPL080C 327 nt4.51□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 NAT1YDL040C 2565 nt4.51□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 SNX41YDR425W 1878 nt4.5□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 ARG2YJL071W 1725 nt4.5□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 YDR340WYDR340W 303 nt4.5□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 MTC3YGL226W 372 nt4.5□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 RPL14BYHL001W 417 nt4.5□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 YHL042WYHL042W 453 nt4.5□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 RPC10YHR143W-A 213 nt4.5□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 YHR217CYHR217C 462 nt4.5□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 AKL1YBR059C 3327 nt4.5□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 PCA1YBR295W 3651 nt4.5□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 GRC3YLL035W 1899 nt4.49□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 SOK2YMR016C 2358 nt4.49□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 HTA1YDR225W 399 nt4.49□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 PAU10YDR542W 363 nt4.49□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 YER188C-AYER188C-A 300 nt4.49□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 PAU11YGL261C 363 nt4.49□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 PAU13YHL046C 363 nt4.49□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 PAU4YLR461W 363 nt4.49□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt4.49□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 LTP1YPR073C 486 nt4.49□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 DAL81YIR023W 2913 nt4.49□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 JEN1YKL217W 1851 nt4.49□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 TAF5YBR198C 2397 nt4.49□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 NUP85YJR042W 2235 nt4.48□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 CDC26YFR036W 375 nt4.48□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 SMD1YGR074W 441 nt4.48□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 APC5YOR249C 2058 nt4.48□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 YHR078WYHR078W 1659 nt4.48□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 YDR338CYDR338C 2088 nt4.47□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 LHP1YDL051W 828 nt4.47□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 MZM1YDR493W 372 nt4.47□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 FMP32YFL046W 624 nt4.47□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 OLI1Q0130 231 nt4.47□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 EGD1YPL037C 474 nt4.47□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 PSP1YDR505C 2526 nt4.47□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 BCK2YER167W 2556 nt4.47□□□□□ -1.69
SRF1Q12516 KRI1YNL308C 1776 nt4.46□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 TFB5YDR079C-A 219 nt4.46□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 DAD4YDR320C-A 219 nt4.46□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 HTB2YBL002W 396 nt4.46□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 snR10snR10 245 nt4.46□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 IMH1YLR309C 2736 nt4.46□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 YGR266WYGR266W 2106 nt4.45□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 MPS3YJL019W 2049 nt4.45□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 SIN4YNL236W 2925 nt4.45□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 INA22YIR024C 651 nt4.45□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 TIM8YJR135W-A 264 nt4.45□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 RPS22BYLR367W 393 nt4.45□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 LSM2YBL026W 288 nt4.45□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt4.45□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 YPL025CYPL025C 558 nt4.45□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 SWD3YBR175W 948 nt4.45□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 YGR125WYGR125W 3111 nt4.45□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 LRE1YCL051W 1752 nt4.45□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 PHO2YDL106C 1680 nt4.45□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 ATP25YMR098C 1839 nt4.44□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 YDL011CYDL011C 324 nt4.44□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 RIP1YEL024W 648 nt4.44□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 YLR053CYLR053C 327 nt4.44□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 ATP15YPL271W 189 nt4.44□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 YDR061WYDR061W 1620 nt4.43□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 PEX11YOL147C 711 nt4.43□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 TPS3YMR261C 3165 nt4.43□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 SIN3YOL004W 4611 nt4.42□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 STE14YDR410C 720 nt4.42□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 RFC3YNL290W 1023 nt4.42□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 MDM32YOR147W 1869 nt4.42□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 OSH2YDL019C 3852 nt4.42□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 SEA4YBL104C 3117 nt4.42□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 PRM15YMR278W 1869 nt4.41□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 GPI13YLL031C 3054 nt4.41□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 RSF2YJR127C 4143 nt4.41□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 RPS23AYGR118W 438 nt4.41□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 CYB5YNL111C 363 nt4.41□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt4.41□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 SSH1YBR283C 1473 nt4.41□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 KIN82YCR091W 2163 nt4.41□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 LCB4YOR171C 1875 nt4.41□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 KRE6YPR159W 2163 nt4.4□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 ICR1ICR1 3199 nt4.4□□□□□ -1.7
SRF1Q12516 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt4.4□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 YER091C-AYER091C-A 222 nt4.4□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 YML116W-AYML116W-A 303 nt4.4□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt4.4□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt4.4□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 snR46snR46 197 nt4.4□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 NUP133YKR082W 3474 nt4.4□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 YBR225WYBR225W 2703 nt4.4□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt4.39□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.4 ms