Protein–RNA interactions for Protein: P47095

MDE1, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, yeastyeast

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDE1P47095 YGR053CYGR053C 852 nt2.52□□□□□ -2.01
MDE1P47095 YGR228WYGR228W 345 nt2.52□□□□□ -2.01
MDE1P47095 SCEIQ0160 708 nt2.52□□□□□ -2.01
MDE1P47095 GIC1YHR061C 945 nt2.52□□□□□ -2.01
MDE1P47095 YJR141WYJR141W 1044 nt2.52□□□□□ -2.01
MDE1P47095 YLR224WYLR224W 1110 nt2.52□□□□□ -2.01
MDE1P47095 RGM1YMR182C 636 nt2.52□□□□□ -2.01
MDE1P47095 HRD3YLR207W 2502 nt2.52□□□□□ -2.01
MDE1P47095 PCK1YKR097W 1650 nt2.52□□□□□ -2.01
MDE1P47095 NPR1YNL183C 2373 nt2.52□□□□□ -2.01
MDE1P47095 MSB2YGR014W 3921 nt2.52□□□□□ -2.01
MDE1P47095 ALY1YKR021W 2748 nt2.51□□□□□ -2.01
MDE1P47095 RTT10YPL183C 3042 nt2.51□□□□□ -2.01
MDE1P47095 INP53YOR109W 3324 nt2.51□□□□□ -2.01
MDE1P47095 GAL80YML051W 1308 nt2.51□□□□□ -2.01
MDE1P47095 MES1YGR264C 2256 nt2.51□□□□□ -2.01
MDE1P47095 YCR090CYCR090C 549 nt2.51□□□□□ -2.01
MDE1P47095 HMF1YER057C 390 nt2.51□□□□□ -2.01
MDE1P47095 RTS3YGR161C 792 nt2.51□□□□□ -2.01
MDE1P47095 LRP1YHR081W 555 nt2.51□□□□□ -2.01
MDE1P47095 PDP3YLR455W 915 nt2.51□□□□□ -2.01
MDE1P47095 SWS2YNL081C 432 nt2.51□□□□□ -2.01
MDE1P47095 NUM1YDR150W 8247 nt2.51□□□□□ -2.01
MDE1P47095 AFR1YDR085C 1863 nt2.51□□□□□ -2.01
MDE1P47095 YEF3YLR249W 3135 nt2.51□□□□□ -2.01
MDE1P47095 SSP1YHR184W 1716 nt2.51□□□□□ -2.01
MDE1P47095 BFR1YOR198C 1413 nt2.51□□□□□ -2.01
MDE1P47095 HSC82YMR186W 2118 nt2.5□□□□□ -2.01
MDE1P47095 GPI19YDR437W 423 nt2.5□□□□□ -2.01
MDE1P47095 YJL086CYJL086C 369 nt2.5□□□□□ -2.01
MDE1P47095 SEC26YDR238C 2922 nt2.5□□□□□ -2.01
MDE1P47095 INP51YIL002C 2841 nt2.5□□□□□ -2.01
MDE1P47095 YEL043WYEL043W 2871 nt2.49□□□□□ -2.01
MDE1P47095 REV3YPL167C 4515 nt2.49□□□□□ -2.01
MDE1P47095 ADK1YDR226W 669 nt2.49□□□□□ -2.01
MDE1P47095 VPH2YKL119C 648 nt2.49□□□□□ -2.01
MDE1P47095 COX8YLR395C 237 nt2.49□□□□□ -2.01
MDE1P47095 YLR456WYLR456W 615 nt2.49□□□□□ -2.01
MDE1P47095 UBX4YMR067C 1251 nt2.49□□□□□ -2.01
MDE1P47095 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.49□□□□□ -2.01
MDE1P47095 TRS20YBR254C 528 nt2.49□□□□□ -2.01
MDE1P47095 MLH1YMR167W 2310 nt2.49□□□□□ -2.01
MDE1P47095 YHR078WYHR078W 1659 nt2.49□□□□□ -2.01
MDE1P47095 YIL166CYIL166C 1629 nt2.49□□□□□ -2.01
MDE1P47095 PBS2YJL128C 2007 nt2.49□□□□□ -2.01
MDE1P47095 SHE4YOR035C 2370 nt2.49□□□□□ -2.01
MDE1P47095 MRD1YPR112C 2664 nt2.48□□□□□ -2.01
MDE1P47095 RGA2YDR379W 3030 nt2.48□□□□□ -2.01
MDE1P47095 YFH1YDL120W 525 nt2.48□□□□□ -2.01
MDE1P47095 YRB1YDR002W 606 nt2.48□□□□□ -2.01
MDE1P47095 SDC1YDR469W 528 nt2.48□□□□□ -2.01
MDE1P47095 MPO1YGL010W 525 nt2.48□□□□□ -2.01
MDE1P47095 RPL14BYHL001W 417 nt2.48□□□□□ -2.01
MDE1P47095 BET4YJL031C 984 nt2.48□□□□□ -2.01
MDE1P47095 CSE4YKL049C 690 nt2.48□□□□□ -2.01
MDE1P47095 ORC1YML065W 2745 nt2.48□□□□□ -2.01
MDE1P47095 KAR9YPL269W 1935 nt2.48□□□□□ -2.01
MDE1P47095 GPI17YDR434W 1605 nt2.47□□□□□ -2.01
MDE1P47095 SWR1YDR334W 4545 nt2.47□□□□□ -2.01
MDE1P47095 UBP15YMR304W 3693 nt2.47□□□□□ -2.01
MDE1P47095 YDR537CYDR537C 606 nt2.47□□□□□ -2.01
MDE1P47095 TWF1YGR080W 999 nt2.47□□□□□ -2.01
MDE1P47095 YIL029CYIL029C 429 nt2.47□□□□□ -2.01
MDE1P47095 ILM1YJR118C 612 nt2.47□□□□□ -2.01
MDE1P47095 YKR051WYKR051W 1257 nt2.47□□□□□ -2.01
MDE1P47095 RPL36AYMR194W 303 nt2.47□□□□□ -2.01
MDE1P47095 YPR014CYPR014C 330 nt2.47□□□□□ -2.01
MDE1P47095 JID1YPR061C 906 nt2.47□□□□□ -2.01
MDE1P47095 SNU114YKL173W 3027 nt2.47□□□□□ -2.01
MDE1P47095 TUS1YLR425W 3924 nt2.46□□□□□ -2.02
MDE1P47095 AXL1YPR122W 3627 nt2.46□□□□□ -2.02
MDE1P47095 GIN4YDR507C 3429 nt2.46□□□□□ -2.02
MDE1P47095 PRE1YER012W 597 nt2.46□□□□□ -2.02
MDE1P47095 TAP42YMR028W 1101 nt2.46□□□□□ -2.02
MDE1P47095 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt2.46□□□□□ -2.02
MDE1P47095 RPL25YOL127W 429 nt2.46□□□□□ -2.02
MDE1P47095 YOR169CYOR169C 465 nt2.46□□□□□ -2.02
MDE1P47095 JIP5YPR169W 1479 nt2.45□□□□□ -2.02
MDE1P47095 KSP1YHR082C 3090 nt2.45□□□□□ -2.02
MDE1P47095 MTC7YEL033W 420 nt2.45□□□□□ -2.02
MDE1P47095 GLC7YER133W 939 nt2.45□□□□□ -2.02
MDE1P47095 YGR290WYGR290W 444 nt2.45□□□□□ -2.02
MDE1P47095 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.45□□□□□ -2.02
MDE1P47095 YML037CYML037C 1023 nt2.45□□□□□ -2.02
MDE1P47095 COX14YML129C 213 nt2.45□□□□□ -2.02
MDE1P47095 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.45□□□□□ -2.02
MDE1P47095 SFM1YOR021C 642 nt2.45□□□□□ -2.02
MDE1P47095 GAL7YBR018C 1101 nt2.45□□□□□ -2.02
MDE1P47095 GIS1YDR096W 2685 nt2.45□□□□□ -2.02
MDE1P47095 YPR089WYPR089W 2667 nt2.45□□□□□ -2.02
MDE1P47095 SHE9YDR393W 1371 nt2.45□□□□□ -2.02
MDE1P47095 YDR186CYDR186C 2634 nt2.44□□□□□ -2.02
MDE1P47095 UBP16YPL072W 1500 nt2.44□□□□□ -2.02
MDE1P47095 IRC2YDR112W 309 nt2.44□□□□□ -2.02
MDE1P47095 VPS74YDR372C 1038 nt2.44□□□□□ -2.02
MDE1P47095 PRM8YGL053W 714 nt2.44□□□□□ -2.02
MDE1P47095 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt2.44□□□□□ -2.02
MDE1P47095 YOR331CYOR331C 558 nt2.44□□□□□ -2.02
MDE1P47095 YRR1YOR162C 2433 nt2.43□□□□□ -2.02
MDE1P47095 YPL150WYPL150W 2706 nt2.43□□□□□ -2.02
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