Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 GRX5YPL059W 453 nt2.43□□□□□ -2.02
SEC28P40509 SNU114YKL173W 3027 nt2.43□□□□□ -2.02
SEC28P40509 UBP15YMR304W 3693 nt2.43□□□□□ -2.02
SEC28P40509 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.42□□□□□ -2.02
SEC28P40509 YOL150CYOL150C 312 nt2.42□□□□□ -2.02
SEC28P40509 TRM7YBR061C 933 nt2.42□□□□□ -2.02
SEC28P40509 TOR1YJR066W 7413 nt2.42□□□□□ -2.02
SEC28P40509 SPF1YEL031W 3648 nt2.41□□□□□ -2.02
SEC28P40509 GIS1YDR096W 2685 nt2.41□□□□□ -2.02
SEC28P40509 SGS1YMR190C 4344 nt2.41□□□□□ -2.02
SEC28P40509 YKL075CYKL075C 1353 nt2.41□□□□□ -2.02
SEC28P40509 PES4YFR023W 1836 nt2.41□□□□□ -2.02
SEC28P40509 YCR099CYCR099C 468 nt2.41□□□□□ -2.02
SEC28P40509 snR70snR70 164 nt2.41□□□□□ -2.02
SEC28P40509 UTP30YKR060W 825 nt2.41□□□□□ -2.02
SEC28P40509 PAU8YAL068C 363 nt2.41□□□□□ -2.02
SEC28P40509 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.41□□□□□ -2.02
SEC28P40509 PAU20YOL161C 363 nt2.41□□□□□ -2.02
SEC28P40509 NSL1YPL233W 651 nt2.41□□□□□ -2.02
SEC28P40509 OSW7YFR039C 1533 nt2.41□□□□□ -2.02
SEC28P40509 YDR186CYDR186C 2634 nt2.4□□□□□ -2.02
SEC28P40509 NCS2YNL119W 1482 nt2.4□□□□□ -2.02
SEC28P40509 YCR064CYCR064C 411 nt2.4□□□□□ -2.03
SEC28P40509 YDR203WYDR203W 318 nt2.4□□□□□ -2.03
SEC28P40509 PGD1YGL025C 1194 nt2.4□□□□□ -2.03
SEC28P40509 VPS51YKR020W 495 nt2.4□□□□□ -2.03
SEC28P40509 PAU23YLR037C 375 nt2.4□□□□□ -2.03
SEC28P40509 KTI11YBL071W-A 249 nt2.4□□□□□ -2.03
SEC28P40509 YNR021WYNR021W 1215 nt2.4□□□□□ -2.03
SEC28P40509 YBR209WYBR209W 318 nt2.4□□□□□ -2.03
SEC28P40509 YPR097WYPR097W 3222 nt2.4□□□□□ -2.03
SEC28P40509 YKR078WYKR078W 1758 nt2.4□□□□□ -2.03
SEC28P40509 STE11YLR362W 2154 nt2.4□□□□□ -2.03
SEC28P40509 BUB1YGR188C 3066 nt2.4□□□□□ -2.03
SEC28P40509 ECM25YJL201W 1800 nt2.4□□□□□ -2.03
SEC28P40509 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt2.4□□□□□ -2.03
SEC28P40509 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt2.4□□□□□ -2.03
SEC28P40509 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt2.4□□□□□ -2.03
SEC28P40509 YCL020WYCL020W 1317 nt2.4□□□□□ -2.03
SEC28P40509 MSB1YOR188W 3414 nt2.39□□□□□ -2.03
SEC28P40509 YDR248CYDR248C 582 nt2.39□□□□□ -2.03
SEC28P40509 RSM18YER050C 417 nt2.39□□□□□ -2.03
SEC28P40509 IGO1YNL157W 507 nt2.39□□□□□ -2.03
SEC28P40509 YNL319WYNL319W 441 nt2.39□□□□□ -2.03
SEC28P40509 snR43snR43 209 nt2.39□□□□□ -2.03
SEC28P40509 YCL002CYCL002C 792 nt2.39□□□□□ -2.03
SEC28P40509 RPN3YER021W 1572 nt2.39□□□□□ -2.03
SEC28P40509 YNL034WYNL034W 1839 nt2.38□□□□□ -2.03
SEC28P40509 TMN3YER113C 2121 nt2.38□□□□□ -2.03
SEC28P40509 SPO11YHL022C 1197 nt2.38□□□□□ -2.03
SEC28P40509 YPK1YKL126W 2043 nt2.38□□□□□ -2.03
SEC28P40509 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.38□□□□□ -2.03
SEC28P40509 RPS17AYML024W 411 nt2.38□□□□□ -2.03
SEC28P40509 OST2YOR103C 393 nt2.38□□□□□ -2.03
SEC28P40509 YBR277CYBR277C 402 nt2.38□□□□□ -2.03
SEC28P40509 SSD1YDR293C 3753 nt2.37□□□□□ -2.03
SEC28P40509 PRK1YIL095W 2433 nt2.37□□□□□ -2.03
SEC28P40509 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.37□□□□□ -2.03
SEC28P40509 SDS22YKL193C 1017 nt2.37□□□□□ -2.03
SEC28P40509 SAS2YMR127C 1017 nt2.37□□□□□ -2.03
SEC28P40509 SRL4YPL033C 846 nt2.37□□□□□ -2.03
SEC28P40509 ALG14YBR070C 714 nt2.37□□□□□ -2.03
SEC28P40509 TOF1YNL273W 3717 nt2.37□□□□□ -2.03
SEC28P40509 LEU3YLR451W 2661 nt2.36□□□□□ -2.03
SEC28P40509 snR59snR59 78 nt2.36□□□□□ -2.03
SEC28P40509 TDA2YER071C 381 nt2.36□□□□□ -2.03
SEC28P40509 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt2.36□□□□□ -2.03
SEC28P40509 SDL1YIL167W 633 nt2.36□□□□□ -2.03
SEC28P40509 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.36□□□□□ -2.03
SEC28P40509 NUP170YBL079W 4509 nt2.36□□□□□ -2.03
SEC28P40509 MLH1YMR167W 2310 nt2.36□□□□□ -2.03
SEC28P40509 ECM5YMR176W 4236 nt2.36□□□□□ -2.03
SEC28P40509 SHE4YOR035C 2370 nt2.36□□□□□ -2.03
SEC28P40509 GPI8YDR331W 1236 nt2.35□□□□□ -2.03
SEC28P40509 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.35□□□□□ -2.03
SEC28P40509 YLR224WYLR224W 1110 nt2.35□□□□□ -2.03
SEC28P40509 YMR144WYMR144W 1029 nt2.35□□□□□ -2.03
SEC28P40509 YNL179CYNL179C 438 nt2.35□□□□□ -2.03
SEC28P40509 SLM4YBR077C 489 nt2.35□□□□□ -2.03
SEC28P40509 ASG1YIL130W 2895 nt2.35□□□□□ -2.03
SEC28P40509 YOL098CYOL098C 3114 nt2.35□□□□□ -2.03
SEC28P40509 AFI1YOR129C 2682 nt2.35□□□□□ -2.03
SEC28P40509 SSE1YPL106C 2082 nt2.34□□□□□ -2.03
SEC28P40509 YDR115WYDR115W 318 nt2.34□□□□□ -2.03
SEC28P40509 VPS74YDR372C 1038 nt2.34□□□□□ -2.03
SEC28P40509 TSA2YDR453C 591 nt2.34□□□□□ -2.03
SEC28P40509 UBC12YLR306W 567 nt2.34□□□□□ -2.03
SEC28P40509 YNL235CYNL235C 432 nt2.34□□□□□ -2.03
SEC28P40509 RSA1YPL193W 1146 nt2.34□□□□□ -2.03
SEC28P40509 ATP20YPR020W 348 nt2.34□□□□□ -2.03
SEC28P40509 JID1YPR061C 906 nt2.34□□□□□ -2.03
SEC28P40509 UBR1YGR184C 5853 nt2.34□□□□□ -2.04
SEC28P40509 ACF4YJR083C 930 nt2.33□□□□□ -2.04
SEC28P40509 RIO2YNL207W 1278 nt2.33□□□□□ -2.04
SEC28P40509 YPR170CYPR170C 336 nt2.33□□□□□ -2.04
SEC28P40509 VPS41YDR080W 2979 nt2.32□□□□□ -2.04
SEC28P40509 FAR7YFR008W 666 nt2.32□□□□□ -2.04
SEC28P40509 YFR056CYFR056C 369 nt2.32□□□□□ -2.04
SEC28P40509 PDP3YLR455W 915 nt2.32□□□□□ -2.04
SEC28P40509 VTI1YMR197C 654 nt2.32□□□□□ -2.04
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