Protein–RNA interactions for Protein: P38788

SSZ1, Ribosome-associated complex subunit SSZ1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1P38788 IGO2YHR132W-A 396 nt3.25□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 YJR023CYJR023C 402 nt3.25□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 RPB11YOL005C 363 nt3.25□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 ERP4YOR016C 624 nt3.25□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt3.24□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt3.24□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt3.24□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt3.24□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt3.24□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 YCL019WYCL019W 5313 nt3.24□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 NIC96YFR002W 2520 nt3.24□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 NUP60YAR002W 1620 nt3.24□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 RTT102YGR275W 474 nt3.24□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt3.24□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.24□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.24□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.24□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.24□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 YAR068WYAR068W 486 nt3.24□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 SPP382YLR424W 2127 nt3.24□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 YLR434CYLR434C 384 nt3.24□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt3.24□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 YNL057WYNL057W 333 nt3.24□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 ISU1YPL135W 498 nt3.24□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 YPR014CYPR014C 330 nt3.24□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 KAP104YBR017C 2757 nt3.24□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 CDH1YGL003C 1701 nt3.24□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 NDT80YHR124W 1884 nt3.24□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 BUD4YJR092W 4344 nt3.23□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 TAO3YIL129C 7131 nt3.23□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 YGR025WYGR025W 303 nt3.23□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 RPL40BYKR094C 387 nt3.23□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 snR13snR13 124 nt3.23□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 YOR385WYOR385W 873 nt3.23□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 snR191snR191 274 nt3.23□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 FLO1YAR050W 4614 nt3.23□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 TFC1YBR123C 1950 nt3.22□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 RPL30YGL030W 318 nt3.22□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 RPS24BYIL069C 408 nt3.22□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 RPS21BYJL136C 264 nt3.22□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 PHD1YKL043W 1101 nt3.22□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 COX19YLL018C-A 297 nt3.22□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 YMR141CYMR141C 309 nt3.22□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 SLM6YBR266C 453 nt3.22□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 MDM32YOR147W 1869 nt3.22□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 SIP3YNL257C 3690 nt3.22□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 EPL1YFL024C 2499 nt3.21□□□□□ -1.89
SSZ1P38788 MSL5YLR116W 1431 nt3.21□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 SEN54YPL083C 1404 nt3.21□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 PDC2YDR081C 2778 nt3.21□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 YKL100CYKL100C 1764 nt3.21□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 APC11YDL008W 498 nt3.21□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt3.21□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 TSA2YDR453C 591 nt3.21□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 YER107W-AYER107W-A 321 nt3.21□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 PXR1YGR280C 816 nt3.21□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt3.21□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 YKL111CYKL111C 336 nt3.21□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 RFC3YNL290W 1023 nt3.21□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt3.21□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt3.21□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 GNT1YOR320C 1476 nt3.21□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 MRH1YDR033W 963 nt3.2□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 ATP17YDR377W 306 nt3.2□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt3.2□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 NOP19YGR251W 591 nt3.2□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 SSN8YNL025C 972 nt3.2□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 NSL1YPL233W 651 nt3.2□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 RAD2YGR258C 3096 nt3.2□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 ATG26YLR189C 3597 nt3.2□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 NPR1YNL183C 2373 nt3.19□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 YER137W-AYER137W-A 306 nt3.19□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 YML099W-AYML099W-A 330 nt3.19□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 YOR199WYOR199W 330 nt3.19□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 YPL276WYPL276W 438 nt3.19□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 DIA2YOR080W 2199 nt3.19□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 TSC11YER093C 4293 nt3.19□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 YGR035CYGR035C 351 nt3.18□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt3.18□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 URA10YMR271C 684 nt3.18□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 YOR121CYOR121C 306 nt3.18□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 RPL20BYOR312C 519 nt3.18□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 YPR039WYPR039W 336 nt3.18□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 EXO84YBR102C 2262 nt3.18□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 DRS2YAL026C 4068 nt3.18□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 COP1YDL145C 3606 nt3.17□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 RPC10YHR143W-A 213 nt3.17□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 YKL136WYKL136W 399 nt3.17□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt3.17□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 RPS1AYLR441C 768 nt3.17□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 UBC7YMR022W 498 nt3.17□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 SWM2YNR004W 441 nt3.17□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 MRPL50YNR022C 420 nt3.17□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 YAT2YER024W 2772 nt3.17□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 CIN8YEL061C 3003 nt3.17□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt3.16□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 PET191YJR034W 327 nt3.16□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 ICY1YMR195W 384 nt3.16□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt3.16□□□□□ -1.9
SSZ1P38788 RPS7BYNL096C 573 nt3.16□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 136.8 ms