Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CFAP69A5D8W1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CFAP69A5D8W1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP69A5D8W1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP69A5D8W1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP69A5D8W1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP69A5D8W1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP69A5D8W1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP69A5D8W1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP69A5D8W1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP69A5D8W1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP69A5D8W1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP69A5D8W1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP69A5D8W1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP69A5D8W1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP69A5D8W1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP69A5D8W1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP69A5D8W1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP69A5D8W1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP69A5D8W1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP69A5D8W1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP69A5D8W1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP69A5D8W1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP69A5D8W1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP69A5D8W1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP69A5D8W1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP69A5D8W1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms