Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFGEF2Q9Y6D5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFGEF2Q9Y6D5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFGEF2Q9Y6D5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFGEF2Q9Y6D5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFGEF2Q9Y6D5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFGEF2Q9Y6D5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFGEF2Q9Y6D5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFGEF2Q9Y6D5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFGEF2Q9Y6D5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFGEF2Q9Y6D5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFGEF2Q9Y6D5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARFGEF2Q9Y6D5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARFGEF2Q9Y6D5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARFGEF2Q9Y6D5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARFGEF2Q9Y6D5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ARFGEF2Q9Y6D5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARFGEF2Q9Y6D5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARFGEF2Q9Y6D5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms