Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms