Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRIP3Q6Q6R5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRIP3Q6Q6R5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRIP3Q6Q6R5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CRIP3Q6Q6R5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRIP3Q6Q6R5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRIP3Q6Q6R5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRIP3Q6Q6R5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRIP3Q6Q6R5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRIP3Q6Q6R5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRIP3Q6Q6R5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRIP3Q6Q6R5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CRIP3Q6Q6R5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CRIP3Q6Q6R5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CRIP3Q6Q6R5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CRIP3Q6Q6R5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms