Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
EEA1Q15075 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
EEA1Q15075 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
EEA1Q15075 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC33.82■■■■□ 3
EEA1Q15075 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
EEA1Q15075 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
EEA1Q15075 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
EEA1Q15075 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
EEA1Q15075 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
EEA1Q15075 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
EEA1Q15075 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
EEA1Q15075 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
EEA1Q15075 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
EEA1Q15075 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC33.81■■■■□ 3
EEA1Q15075 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC33.81■■■■□ 3
EEA1Q15075 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
EEA1Q15075 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
EEA1Q15075 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
EEA1Q15075 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
EEA1Q15075 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
EEA1Q15075 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
EEA1Q15075 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
EEA1Q15075 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
EEA1Q15075 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
EEA1Q15075 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
EEA1Q15075 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
EEA1Q15075 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
EEA1Q15075 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
EEA1Q15075 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
EEA1Q15075 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
EEA1Q15075 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
EEA1Q15075 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
EEA1Q15075 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
EEA1Q15075 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
EEA1Q15075 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
EEA1Q15075 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
EEA1Q15075 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC33.79■■■■□ 3
EEA1Q15075 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
EEA1Q15075 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
EEA1Q15075 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
EEA1Q15075 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
EEA1Q15075 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
EEA1Q15075 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
EEA1Q15075 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC33.79■■■■□ 3
EEA1Q15075 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
EEA1Q15075 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
EEA1Q15075 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC33.79■■■■□ 3
EEA1Q15075 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
EEA1Q15075 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
EEA1Q15075 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
EEA1Q15075 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
EEA1Q15075 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
EEA1Q15075 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
EEA1Q15075 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
EEA1Q15075 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
EEA1Q15075 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
EEA1Q15075 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
EEA1Q15075 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
EEA1Q15075 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms