Protein–RNA interactions for Protein: Q08438

VHS3, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase subunit VHS3, yeastyeast

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS3Q08438 SSN8YNL025C 972 nt3.37□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 RFC3YNL290W 1023 nt3.37□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 PFK26YIL107C 2484 nt3.37□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.37□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 GLC3YEL011W 2115 nt3.37□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 SLP1YOR154W 1764 nt3.36□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 BNI4YNL233W 2679 nt3.36□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 RAD5YLR032W 3510 nt3.36□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 PXR1YGR280C 816 nt3.36□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 CRG1YHR209W 876 nt3.36□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 DLS1YJL065C 504 nt3.36□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 YLR287CYLR287C 1068 nt3.36□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 YLR302CYLR302C 363 nt3.36□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 YOR392WYOR392W 444 nt3.36□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 GPI17YDR434W 1605 nt3.36□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 EMP70YLR083C 2004 nt3.36□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt3.35□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 GPI19YDR437W 423 nt3.35□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 YER038W-AYER038W-A 381 nt3.35□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 YER068C-AYER068C-A 432 nt3.35□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 MTC3YGL226W 372 nt3.35□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 RRF1YHR038W 693 nt3.35□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 LSM8YJR022W 330 nt3.35□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 RPL22AYLR061W 366 nt3.35□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 CIN8YEL061C 3003 nt3.35□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 UTP13YLR222C 2454 nt3.34□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 VPS3YDR495C 3036 nt3.34□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 ALY1YKR021W 2748 nt3.34□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 YPS5YGL259W 498 nt3.34□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt3.34□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 TEN1YLR010C 483 nt3.34□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 GOT1YMR292W 417 nt3.34□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 YBL071CYBL071C 309 nt3.34□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 YOL134CYOL134C 390 nt3.34□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 YBR032WYBR032W 303 nt3.34□□□□□ -1.87
VHS3Q08438 SMB1YER029C 591 nt3.33□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 PRP8YHR165C 7242 nt3.33□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 HHT2YNL031C 411 nt3.33□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt3.33□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 DNM1YLL001W 2274 nt3.33□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 RIF1YBR275C 5751 nt3.33□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 IOC3YFR013W 2364 nt3.32□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt3.32□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 RPS28BYLR264W 204 nt3.32□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 HSP10YOR020C 321 nt3.32□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 YNR063WYNR063W 1824 nt3.32□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 MSR1YHR091C 1932 nt3.32□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 VTC4YJL012C 2166 nt3.32□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 ENA2YDR039C 3276 nt3.32□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 ENA1YDR040C 3276 nt3.32□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt3.31□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 HIT1YJR055W 495 nt3.31□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 YLR230WYLR230W 306 nt3.31□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 SEC22YLR268W 645 nt3.31□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 BSC3YLR465C 309 nt3.31□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 YPR197CYPR197C 564 nt3.31□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 FLO1YAR050W 4614 nt3.31□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 MES1YGR264C 2256 nt3.31□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 DIA2YOR080W 2199 nt3.31□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 DYN1YKR054C 12279 nt3.31□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 STN1YDR082W 1485 nt3.3□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 FAA2YER015W 2235 nt3.3□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 DOA4YDR069C 2781 nt3.3□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 TCP1YDR212W 1680 nt3.3□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 ARK1YNL020C 1917 nt3.29□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 RPL30YGL030W 318 nt3.29□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 RPS20YHL015W 366 nt3.29□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 YIL012WYIL012W 342 nt3.29□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 YMR141CYMR141C 309 nt3.29□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 YNL146WYNL146W 303 nt3.29□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 CDC33YOL139C 642 nt3.29□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 YOL150CYOL150C 312 nt3.29□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 YPL080CYPL080C 327 nt3.29□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 ENA5YDR038C 3276 nt3.29□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 CDH1YGL003C 1701 nt3.28□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 RPL29YFR032C-A 180 nt3.28□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 PEX17YNL214W 600 nt3.28□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 YDL180WYDL180W 1644 nt3.28□□□□□ -1.88
VHS3Q08438 TFC1YBR123C 1950 nt3.27□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 RIX1YHR197W 2292 nt3.27□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 EPL1YFL024C 2499 nt3.27□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 YGL165CYGL165C 579 nt3.27□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 RNR4YGR180C 1038 nt3.27□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 PAU23YLR037C 375 nt3.27□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 LSM2YBL026W 288 nt3.27□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 YPL197CYPL197C 414 nt3.27□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 NOP4YPL043W 2058 nt3.27□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 EXO84YBR102C 2262 nt3.27□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 RNH70YGR276C 1662 nt3.27□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 CSR2YPR030W 3366 nt3.26□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt3.26□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt3.26□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt3.26□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt3.26□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt3.26□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 YCL019WYCL019W 5313 nt3.26□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 AKR1YDR264C 2295 nt3.26□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 YJR079WYJR079W 330 nt3.26□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 RNP1YLL046C 750 nt3.26□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.9 ms