Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms