Protein–RNA interactions for Protein: P89113

DDR2, Protein DDR2, yeast

Predictions only

Length 61 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	P89113	BSC2	YDR275W	708 nt		0.41	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	YDR461C-A	YDR461C-A	243 nt		0.41	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	SNL1	YIL016W	480 nt		0.41	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	YML009C-A	YML009C-A	327 nt		0.41	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	YNL179C	YNL179C	438 nt		0.41	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	RIT1	YMR283C	1542 nt		0.41	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	TRZ1	YKR079C	2517 nt		0.41	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	ZRG17	YNR039C	1818 nt		0.41	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	GAT2	YMR136W	1683 nt		0.4	□□□□□ -2.34
DDR2	P89113	UPS3	YDR185C	540 nt		0.4	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	NOP19	YGR251W	591 nt		0.4	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	YHL044W	YHL044W	708 nt		0.4	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	YIP3	YNL044W	531 nt		0.4	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	YLR108C	YLR108C	1458 nt		0.4	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	PBP4	YDL053C	558 nt		0.39	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	tT(AGU)B	tT(AGU)B	73 nt		0.39	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	tT(AGU)C	tT(AGU)C	73 nt		0.39	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	tT(AGU)D	tT(AGU)D	73 nt		0.39	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	tT(AGU)H	tT(AGU)H	73 nt		0.39	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	tT(AGU)I1	tT(AGU)I1	73 nt		0.39	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	tT(AGU)I2	tT(AGU)I2	73 nt		0.39	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	tT(AGU)J	tT(AGU)J	73 nt		0.39	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	tT(AGU)N1	tT(AGU)N1	73 nt		0.39	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	tT(AGU)N2	tT(AGU)N2	73 nt		0.39	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	tT(AGU)O1	tT(AGU)O1	73 nt		0.39	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	tT(AGU)O2	tT(AGU)O2	73 nt		0.39	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	YMR031W-A	YMR031W-A	327 nt		0.39	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	ATX2	YOR079C	942 nt		0.39	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	SHS1	YDL225W	1656 nt		0.39	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	GRR1	YJR090C	3456 nt		0.39	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	PET100	YDR079W	336 nt		0.38	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	YER119C-A	YER119C-A	372 nt		0.38	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	CSM2	YIL132C	642 nt		0.38	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	YKR075W-A	YKR075W-A	270 nt		0.38	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	YAR075W	YAR075W	474 nt		0.38	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	YOR292C	YOR292C	930 nt		0.38	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	EAP1	YKL204W	1899 nt		0.37	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	YCT1	YLL055W	1596 nt		0.37	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	YDR132C	YDR132C	1488 nt		0.37	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	ATP16	YDL004W	483 nt		0.37	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	YGL193C	YGL193C	312 nt		0.37	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	RNR4	YGR180C	1038 nt		0.37	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	CIC1	YHR052W	1131 nt		0.37	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	RPL40A	YIL148W	387 nt		0.37	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	YJL015C	YJL015C	285 nt		0.37	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	ECI1	YLR284C	843 nt		0.37	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	MLH3	YPL164C	2148 nt		0.37	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	GCD2	YGR083C	1956 nt		0.36	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	BST1	YFL025C	3090 nt		0.36	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	APL3	YBL037W	3078 nt		0.36	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	MDM32	YOR147W	1869 nt		0.36	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	YDL026W	YDL026W	312 nt		0.36	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	YJL202C	YJL202C	348 nt		0.36	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	AIM4	YBR194W	372 nt		0.36	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	SKO1	YNL167C	1944 nt		0.36	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	APL2	YKL135C	2181 nt		0.36	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	SEC59	YMR013C	1560 nt		0.36	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	SLK19	YOR195W	2466 nt		0.36	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	YER107W-A	YER107W-A	321 nt		0.35	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	YIL068W-A	YIL068W-A	384 nt		0.35	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	YIL142C-A	YIL142C-A	333 nt		0.35	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	YUH1	YJR099W	711 nt		0.35	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	VMA5	YKL080W	1179 nt		0.35	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	YLR307C-A	YLR307C-A	264 nt		0.35	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	VTI1	YMR197C	654 nt		0.35	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	SWI6	YLR182W	2412 nt		0.34	□□□□□ -2.35
DDR2	P89113	KEI1	YDR367W	666 nt		0.34	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	YKL070W	YKL070W	510 nt		0.34	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	YNL235C	YNL235C	432 nt		0.34	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	SNC2	YOR327C	348 nt		0.34	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	YML002W	YML002W	2214 nt		0.34	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	NUP145	YGL092W	3954 nt		0.33	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	YDR115W	YDR115W	318 nt		0.33	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	SDC1	YDR469W	528 nt		0.33	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	NBL1	YHR199C-A	222 nt		0.33	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	HYR1	YIR037W	492 nt		0.33	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	TPP1	YMR156C	717 nt		0.33	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	DYN3	YMR299C	939 nt		0.33	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	YOR152C	YOR152C	771 nt		0.33	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	YPR146C	YPR146C	330 nt		0.33	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	SAS3	YBL052C	2496 nt		0.33	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	URC2	YDR520C	2319 nt		0.33	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	SPB4	YFL002C	1821 nt		0.33	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	YNL034W	YNL034W	1839 nt		0.33	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	CTR9	YOL145C	3234 nt		0.32	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	AGE1	YDR524C	1449 nt		0.32	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	PIP2	YOR363C	2991 nt		0.32	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	YER087C-A	YER087C-A	552 nt		0.32	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	CTK3	YML112W	891 nt		0.32	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	EAF7	YNL136W	1278 nt		0.32	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	CUR1	YPR158W	759 nt		0.32	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	SPR3	YGR059W	1539 nt		0.32	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	TRL1	YJL087C	2484 nt		0.31	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	PIG2	YIL045W	1617 nt		0.31	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	URM1	YIL008W	300 nt		0.31	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	RSA3	YLR221C	663 nt		0.31	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	YMR144W	YMR144W	1029 nt		0.31	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	YBR032W	YBR032W	303 nt		0.31	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	RRI1	YDL216C	1323 nt		0.31	□□□□□ -2.36
DDR2	P89113	YDR018C	YDR018C	1191 nt		0.3	□□□□□ -2.36

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