Protein–RNA interactions for Protein: P53437

RRN9, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN9, yeastyeast

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN9P53437 UBC5YDR059C 447 nt2.4□□□□□ -2.03
RRN9P53437 FAR7YFR008W 666 nt2.4□□□□□ -2.03
RRN9P53437 YGR293CYGR293C 462 nt2.4□□□□□ -2.03
RRN9P53437 HSP10YOR020C 321 nt2.4□□□□□ -2.03
RRN9P53437 RRG8YPR116W 834 nt2.4□□□□□ -2.03
RRN9P53437 FAR11YNL127W 2862 nt2.4□□□□□ -2.03
RRN9P53437 SIN3YOL004W 4611 nt2.4□□□□□ -2.03
RRN9P53437 KRE33YNL132W 3171 nt2.4□□□□□ -2.03
RRN9P53437 YPL216WYPL216W 3309 nt2.4□□□□□ -2.03
RRN9P53437 STD1YOR047C 1335 nt2.4□□□□□ -2.03
RRN9P53437 YKR078WYKR078W 1758 nt2.39□□□□□ -2.03
RRN9P53437 YPL150WYPL150W 2706 nt2.39□□□□□ -2.03
RRN9P53437 GCV2YMR189W 3105 nt2.39□□□□□ -2.03
RRN9P53437 YDR018CYDR018C 1191 nt2.39□□□□□ -2.03
RRN9P53437 PRP38YGR075C 729 nt2.39□□□□□ -2.03
RRN9P53437 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.39□□□□□ -2.03
RRN9P53437 YLR224WYLR224W 1110 nt2.39□□□□□ -2.03
RRN9P53437 RPS29AYLR388W 171 nt2.39□□□□□ -2.03
RRN9P53437 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt2.39□□□□□ -2.03
RRN9P53437 ESF2YNR054C 951 nt2.39□□□□□ -2.03
RRN9P53437 YOL134CYOL134C 390 nt2.39□□□□□ -2.03
RRN9P53437 MUD1YBR119W 897 nt2.39□□□□□ -2.03
RRN9P53437 NEL1YHR035W 1893 nt2.39□□□□□ -2.03
RRN9P53437 YBT1YLL048C 4986 nt2.39□□□□□ -2.03
RRN9P53437 SEC26YDR238C 2922 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN9P53437 TRZ1YKR079C 2517 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN9P53437 MFB1YDR219C 1398 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN9P53437 RPO41YFL036W 4056 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN9P53437 NCB2YDR397C 441 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN9P53437 TMA20YER007C-A 546 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN9P53437 RPS26BYER131W 360 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN9P53437 YMR31YFR049W 372 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN9P53437 RTS3YGR161C 792 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN9P53437 YJL119CYJL119C 324 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN9P53437 AYT1YLL063C 1425 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN9P53437 COX14YML129C 213 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN9P53437 KTI11YBL071W-A 249 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN9P53437 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN9P53437 RLF2YPR018W 1821 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN9P53437 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.37□□□□□ -2.03
RRN9P53437 FIR1YER032W 2631 nt2.37□□□□□ -2.03
RRN9P53437 snR59snR59 78 nt2.37□□□□□ -2.03
RRN9P53437 VMA21YGR105W 234 nt2.37□□□□□ -2.03
RRN9P53437 SDL1YIL167W 633 nt2.37□□□□□ -2.03
RRN9P53437 YJR087WYJR087W 351 nt2.37□□□□□ -2.03
RRN9P53437 COA4YLR218C 453 nt2.37□□□□□ -2.03
RRN9P53437 ATP18YML081C-A 180 nt2.37□□□□□ -2.03
RRN9P53437 YOR169CYOR169C 465 nt2.37□□□□□ -2.03
RRN9P53437 SWR1YDR334W 4545 nt2.37□□□□□ -2.03
RRN9P53437 POM152YMR129W 4014 nt2.37□□□□□ -2.03
RRN9P53437 IRA2YOL081W 9240 nt2.37□□□□□ -2.03
RRN9P53437 ORC1YML065W 2745 nt2.37□□□□□ -2.03
RRN9P53437 YHR078WYHR078W 1659 nt2.37□□□□□ -2.03
RRN9P53437 ARP8YOR141C 2646 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN9P53437 GIN4YDR507C 3429 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN9P53437 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN9P53437 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN9P53437 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN9P53437 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN9P53437 YGR242WYGR242W 309 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN9P53437 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN9P53437 RPS1AYLR441C 768 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN9P53437 ERG29YMR134W 714 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN9P53437 YMR187CYMR187C 1296 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN9P53437 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN9P53437 PEP12YOR036W 867 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN9P53437 OST2YOR103C 393 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN9P53437 VID24YBR105C 1089 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN9P53437 SHE4YOR035C 2370 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN9P53437 DAL5YJR152W 1632 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN9P53437 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN9P53437 DNL4YOR005C 2835 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN9P53437 YDR537CYDR537C 606 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN9P53437 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN9P53437 ERV1YGR029W 570 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN9P53437 SLX9YGR081C 633 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN9P53437 YGR228WYGR228W 345 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN9P53437 CKA1YIL035C 1119 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN9P53437 ACF4YJR083C 930 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN9P53437 GMC2YLR445W 567 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN9P53437 YOL150CYOL150C 312 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN9P53437 ATP3YBR039W 936 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN9P53437 DBP10YDL031W 2988 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN9P53437 GAL80YML051W 1308 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN9P53437 BAS1YKR099W 2436 nt2.34□□□□□ -2.03
RRN9P53437 TRS130YMR218C 3309 nt2.34□□□□□ -2.03
RRN9P53437 PUF4YGL014W 2667 nt2.34□□□□□ -2.03
RRN9P53437 VPS74YDR372C 1038 nt2.34□□□□□ -2.03
RRN9P53437 PRE1YER012W 597 nt2.34□□□□□ -2.03
RRN9P53437 YER189WYER189W 369 nt2.34□□□□□ -2.03
RRN9P53437 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.34□□□□□ -2.03
RRN9P53437 OTU2YHL013C 924 nt2.34□□□□□ -2.03
RRN9P53437 YKL066WYKL066W 444 nt2.34□□□□□ -2.03
RRN9P53437 TAP42YMR028W 1101 nt2.34□□□□□ -2.03
RRN9P53437 YMR144WYMR144W 1029 nt2.34□□□□□ -2.03
RRN9P53437 RRI2YOL117W 1938 nt2.34□□□□□ -2.04
RRN9P53437 MLH1YMR167W 2310 nt2.34□□□□□ -2.04
RRN9P53437 UBP15YMR304W 3693 nt2.33□□□□□ -2.04
RRN9P53437 YEF3YLR249W 3135 nt2.33□□□□□ -2.04
RRN9P53437 TOR1YJR066W 7413 nt2.33□□□□□ -2.04
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