Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 YOR385WYOR385W 873 nt3.15□□□□□ -1.91
VFA1P40080 ARR2YPR200C 393 nt3.15□□□□□ -1.91
VFA1P40080 AVT2YEL064C 1443 nt3.15□□□□□ -1.91
VFA1P40080 ILS1YBL076C 3219 nt3.15□□□□□ -1.91
VFA1P40080 ITC1YGL133W 3795 nt3.14□□□□□ -1.91
VFA1P40080 YMR018WYMR018W 1545 nt3.14□□□□□ -1.91
VFA1P40080 RTS3YGR161C 792 nt3.14□□□□□ -1.91
VFA1P40080 ARV1YLR242C 966 nt3.14□□□□□ -1.91
VFA1P40080 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt3.14□□□□□ -1.91
VFA1P40080 RPL6AYML073C 531 nt3.14□□□□□ -1.91
VFA1P40080 YML108WYML108W 318 nt3.14□□□□□ -1.91
VFA1P40080 RPL19BYBL027W 570 nt3.14□□□□□ -1.91
VFA1P40080 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt3.14□□□□□ -1.91
VFA1P40080 CAT5YOR125C 702 nt3.14□□□□□ -1.91
VFA1P40080 ATP22YDR350C 2055 nt3.14□□□□□ -1.91
VFA1P40080 HAA1YPR008W 2085 nt3.14□□□□□ -1.91
VFA1P40080 MDV1YJL112W 2145 nt3.14□□□□□ -1.91
VFA1P40080 YLR278CYLR278C 4026 nt3.14□□□□□ -1.91
VFA1P40080 ROG1YGL144C 2058 nt3.13□□□□□ -1.91
VFA1P40080 SPP382YLR424W 2127 nt3.13□□□□□ -1.91
VFA1P40080 YKR078WYKR078W 1758 nt3.13□□□□□ -1.91
VFA1P40080 SPO14YKR031C 5052 nt3.13□□□□□ -1.91
VFA1P40080 HUR1YGL168W 333 nt3.13□□□□□ -1.91
VFA1P40080 MCR1YKL150W 909 nt3.13□□□□□ -1.91
VFA1P40080 YLR302CYLR302C 363 nt3.13□□□□□ -1.91
VFA1P40080 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt3.13□□□□□ -1.91
VFA1P40080 HEM4YOR278W 828 nt3.13□□□□□ -1.91
VFA1P40080 SWD3YBR175W 948 nt3.13□□□□□ -1.91
VFA1P40080 snR54snR54 86 nt3.13□□□□□ -1.91
VFA1P40080 PAM1YDR251W 2493 nt3.12□□□□□ -1.91
VFA1P40080 MES1YGR264C 2256 nt3.12□□□□□ -1.91
VFA1P40080 YPL216WYPL216W 3309 nt3.12□□□□□ -1.91
VFA1P40080 SRC1YML034W 2505 nt3.12□□□□□ -1.91
VFA1P40080 YDL242WYDL242W 354 nt3.12□□□□□ -1.91
VFA1P40080 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt3.12□□□□□ -1.91
VFA1P40080 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt3.12□□□□□ -1.91
VFA1P40080 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt3.12□□□□□ -1.91
VFA1P40080 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt3.12□□□□□ -1.91
VFA1P40080 MRPL38YKL170W 417 nt3.12□□□□□ -1.91
VFA1P40080 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt3.12□□□□□ -1.91
VFA1P40080 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt3.12□□□□□ -1.91
VFA1P40080 SSN8YNL025C 972 nt3.12□□□□□ -1.91
VFA1P40080 HHT2YNL031C 411 nt3.12□□□□□ -1.91
VFA1P40080 IRC16YPR038W 360 nt3.12□□□□□ -1.91
VFA1P40080 YME2YMR302C 2553 nt3.12□□□□□ -1.91
VFA1P40080 SPE1YKL184W 1401 nt3.11□□□□□ -1.91
VFA1P40080 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt3.11□□□□□ -1.91
VFA1P40080 MRH1YDR033W 963 nt3.11□□□□□ -1.91
VFA1P40080 GIM4YEL003W 336 nt3.11□□□□□ -1.91
VFA1P40080 AST2YER101C 1293 nt3.11□□□□□ -1.91
VFA1P40080 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt3.11□□□□□ -1.91
VFA1P40080 YAL037WYAL037W 804 nt3.11□□□□□ -1.91
VFA1P40080 YPL034WYPL034W 498 nt3.11□□□□□ -1.91
VFA1P40080 LEE1YPL054W 906 nt3.11□□□□□ -1.91
VFA1P40080 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.11□□□□□ -1.91
VFA1P40080 BIT61YJL058C 1632 nt3.11□□□□□ -1.91
VFA1P40080 TFB1YDR311W 1929 nt3.11□□□□□ -1.91
VFA1P40080 PPN1YDR452W 2025 nt3.1□□□□□ -1.91
VFA1P40080 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.1□□□□□ -1.91
VFA1P40080 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.1□□□□□ -1.91
VFA1P40080 YER038W-AYER038W-A 381 nt3.1□□□□□ -1.91
VFA1P40080 IES5YER092W 378 nt3.1□□□□□ -1.91
VFA1P40080 YLR101CYLR101C 396 nt3.1□□□□□ -1.91
VFA1P40080 SMA2YML066C 1110 nt3.1□□□□□ -1.91
VFA1P40080 SMC2YFR031C 3513 nt3.09□□□□□ -1.91
VFA1P40080 MRP49YKL167C 414 nt3.09□□□□□ -1.91
VFA1P40080 PAU23YLR037C 375 nt3.09□□□□□ -1.91
VFA1P40080 PKR1YMR123W 369 nt3.09□□□□□ -1.91
VFA1P40080 YPL261CYPL261C 309 nt3.09□□□□□ -1.91
VFA1P40080 DIA2YOR080W 2199 nt3.09□□□□□ -1.91
VFA1P40080 NMA111YNL123W 2994 nt3.09□□□□□ -1.92
VFA1P40080 YCR064CYCR064C 411 nt3.08□□□□□ -1.92
VFA1P40080 CBS1YDL069C 690 nt3.08□□□□□ -1.92
VFA1P40080 YHR125WYHR125W 306 nt3.08□□□□□ -1.92
VFA1P40080 CDC123YLR215C 1083 nt3.08□□□□□ -1.92
VFA1P40080 AIM36YMR157C 768 nt3.08□□□□□ -1.92
VFA1P40080 NOP15YNL110C 663 nt3.08□□□□□ -1.92
VFA1P40080 YOL150CYOL150C 312 nt3.08□□□□□ -1.92
VFA1P40080 snR191snR191 274 nt3.08□□□□□ -1.92
VFA1P40080 DOA4YDR069C 2781 nt3.08□□□□□ -1.92
VFA1P40080 YGR067CYGR067C 2415 nt3.07□□□□□ -1.92
VFA1P40080 YDR193WYDR193W 399 nt3.07□□□□□ -1.92
VFA1P40080 ERG28YER044C 447 nt3.07□□□□□ -1.92
VFA1P40080 HMF1YER057C 390 nt3.07□□□□□ -1.92
VFA1P40080 VFA1YER128W 612 nt3.07□□□□□ -1.92
VFA1P40080 NFU1YKL040C 771 nt3.07□□□□□ -1.92
VFA1P40080 BET3YKR068C 582 nt3.07□□□□□ -1.92
VFA1P40080 RPL33AYPL143W 324 nt3.07□□□□□ -1.92
VFA1P40080 YPR014CYPR014C 330 nt3.07□□□□□ -1.92
VFA1P40080 GYP7YDL234C 2241 nt3.07□□□□□ -1.92
VFA1P40080 TRZ1YKR079C 2517 nt3.07□□□□□ -1.92
VFA1P40080 SEA4YBL104C 3117 nt3.06□□□□□ -1.92
VFA1P40080 YER006C-AYER006C-A 318 nt3.06□□□□□ -1.92
VFA1P40080 RPL23BYER117W 414 nt3.06□□□□□ -1.92
VFA1P40080 RPL29YFR032C-A 180 nt3.06□□□□□ -1.92
VFA1P40080 CDC55YGL190C 1581 nt3.06□□□□□ -1.92
VFA1P40080 VPH2YKL119C 648 nt3.06□□□□□ -1.92
VFA1P40080 MRP8YKL142W 660 nt3.06□□□□□ -1.92
VFA1P40080 LSM2YBL026W 288 nt3.06□□□□□ -1.92
VFA1P40080 CMC2YBL059C-A 330 nt3.06□□□□□ -1.92
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