Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL2P13500 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL2P13500 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL2P13500 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL2P13500 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL2P13500 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL2P13500 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL2P13500 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL2P13500 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL2P13500 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL2P13500 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL2P13500 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL2P13500 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL2P13500 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL2P13500 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL2P13500 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL2P13500 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL2P13500 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL2P13500 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL2P13500 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL2P13500 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL2P13500 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL2P13500 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL2P13500 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL2P13500 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL2P13500 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL2P13500 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL2P13500 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL2P13500 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL2P13500 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL2P13500 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL2P13500 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL2P13500 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL2P13500 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL2P13500 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL2P13500 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL2P13500 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL2P13500 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL2P13500 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL2P13500 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL2P13500 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL2P13500 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL2P13500 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL2P13500 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL2P13500 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL2P13500 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL2P13500 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL2P13500 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL2P13500 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL2P13500 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL2P13500 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL2P13500 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL2P13500 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL2P13500 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL2P13500 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL2P13500 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL2P13500 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL2P13500 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL2P13500 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL2P13500 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL2P13500 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL2P13500 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL2P13500 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL2P13500 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL2P13500 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL2P13500 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL2P13500 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL2P13500 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL2P13500 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL2P13500 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL2P13500 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL2P13500 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL2P13500 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL2P13500 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL2P13500 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL2P13500 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL2P13500 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL2P13500 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL2P13500 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL2P13500 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL2P13500 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL2P13500 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL2P13500 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL2P13500 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL2P13500 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL2P13500 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL2P13500 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL2P13500 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL2P13500 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL2P13500 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL2P13500 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL2P13500 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL2P13500 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL2P13500 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL2P13500 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL2P13500 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL2P13500 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL2P13500 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL2P13500 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL2P13500 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms