Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
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