Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms