Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms