Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME3Q16798 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME3Q16798 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME3Q16798 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME3Q16798 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME3Q16798 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME3Q16798 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME3Q16798 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME3Q16798 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME3Q16798 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME3Q16798 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME3Q16798 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME3Q16798 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME3Q16798 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME3Q16798 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME3Q16798 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME3Q16798 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME3Q16798 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME3Q16798 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME3Q16798 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME3Q16798 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME3Q16798 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME3Q16798 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME3Q16798 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME3Q16798 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME3Q16798 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME3Q16798 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ME3Q16798 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ME3Q16798 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ME3Q16798 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ME3Q16798 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ME3Q16798 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ME3Q16798 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ME3Q16798 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ME3Q16798 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ME3Q16798 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ME3Q16798 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ME3Q16798 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ME3Q16798 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ME3Q16798 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ME3Q16798 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ME3Q16798 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ME3Q16798 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ME3Q16798 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ME3Q16798 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ME3Q16798 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ME3Q16798 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ME3Q16798 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ME3Q16798 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ME3Q16798 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ME3Q16798 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ME3Q16798 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ME3Q16798 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ME3Q16798 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ME3Q16798 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ME3Q16798 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ME3Q16798 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ME3Q16798 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ME3Q16798 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ME3Q16798 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ME3Q16798 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ME3Q16798 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ME3Q16798 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ME3Q16798 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ME3Q16798 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ME3Q16798 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ME3Q16798 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ME3Q16798 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ME3Q16798 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ME3Q16798 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ME3Q16798 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME3Q16798 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME3Q16798 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME3Q16798 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME3Q16798 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME3Q16798 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME3Q16798 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME3Q16798 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME3Q16798 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME3Q16798 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME3Q16798 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME3Q16798 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME3Q16798 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME3Q16798 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME3Q16798 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME3Q16798 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME3Q16798 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME3Q16798 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME3Q16798 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME3Q16798 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME3Q16798 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ME3Q16798 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME3Q16798 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME3Q16798 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ME3Q16798 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME3Q16798 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME3Q16798 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME3Q16798 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME3Q16798 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME3Q16798 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
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