Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIF1AQ16665 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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HIF1AQ16665 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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