Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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EXT1Q16394 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXT1Q16394 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXT1Q16394 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
EXT1Q16394 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXT1Q16394 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXT1Q16394 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXT1Q16394 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXT1Q16394 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXT1Q16394 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXT1Q16394 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXT1Q16394 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXT1Q16394 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXT1Q16394 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXT1Q16394 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXT1Q16394 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EXT1Q16394 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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EXT1Q16394 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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EXT1Q16394 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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EXT1Q16394 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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EXT1Q16394 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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EXT1Q16394 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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EXT1Q16394 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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