Protein–RNA interactions for Protein: Q12516

SRF1, Regulator of phospholipase D SRF1, yeastyeast

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRF1Q12516 IST1YNL265C 897 nt4.78□□□□□ -1.64
SRF1Q12516 OCA5YHL029C 2040 nt4.78□□□□□ -1.64
SRF1Q12516 RKM1YPL208W 1752 nt4.78□□□□□ -1.64
SRF1Q12516 UTP13YLR222C 2454 nt4.78□□□□□ -1.64
SRF1Q12516 HTL1YCR020W-B 237 nt4.77□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 YDR193WYDR193W 399 nt4.77□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 SIP18YMR175W 240 nt4.77□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 YBR197CYBR197C 654 nt4.77□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 YER077CYER077C 2067 nt4.77□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 PBS2YJL128C 2007 nt4.77□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 SHQ1YIL104C 1524 nt4.77□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 YJL132WYJL132W 2253 nt4.76□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 YDL180WYDL180W 1644 nt4.76□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 VIK1YPL253C 1944 nt4.76□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 YGL042CYGL042C 306 nt4.76□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt4.76□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 YAR068WYAR068W 486 nt4.76□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 YBL053WYBL053W 375 nt4.76□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 PHO88YBR106W 567 nt4.76□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 RAD4YER162C 2265 nt4.76□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 DSF2YBR007C 2211 nt4.76□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 BYE1YKL005C 1785 nt4.76□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 GCN20YFR009W 2259 nt4.75□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt4.75□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 YGL052WYGL052W 306 nt4.75□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 ECM34YHL043W 513 nt4.75□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 YLR140WYLR140W 327 nt4.75□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt4.75□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt4.75□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 ROK1YGL171W 1695 nt4.75□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 GPR1YDL035C 2886 nt4.75□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 NDC80YIL144W 2076 nt4.74□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 MDM30YLR368W 1797 nt4.74□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 RPS7BYNL096C 573 nt4.74□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 OM14YBR230C 405 nt4.74□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 COX1Q0045 1605 nt4.74□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 YRR1YOR162C 2433 nt4.74□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 PDR15YDR406W 4590 nt4.73□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 FRE3YOR381W 2136 nt4.73□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 FLO8YER109C 2400 nt4.73□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 ROT2YBR229C 2865 nt4.73□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 NRD1YNL251C 1728 nt4.73□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 ECT1YGR007W 972 nt4.73□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 RAD61YDR014W 1944 nt4.73□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 YDL199CYDL199C 2064 nt4.73□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 EPT1YHR123W 1176 nt4.72□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 PSY1YKL076C 384 nt4.72□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 TVP18YMR071C 504 nt4.72□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 HOYDL227C 1761 nt4.72□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 SSY5YJL156C 2100 nt4.72□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 YOL075CYOL075C 3885 nt4.72□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt4.71□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt4.71□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt4.71□□□□□ -1.65
SRF1Q12516 YNL193WYNL193W 1677 nt4.71□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 GPG1YGL121C 381 nt4.71□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 PAU14YIL176C 363 nt4.71□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 PAU1YJL223C 363 nt4.71□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 DAK1YML070W 1755 nt4.7□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 HDA2YDR295C 2025 nt4.7□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 KIN4YOR233W 2403 nt4.7□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 ATP17YDR377W 306 nt4.7□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 YER066C-AYER066C-A 501 nt4.7□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 SPP382YLR424W 2127 nt4.7□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 TPA1YER049W 1935 nt4.7□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt4.69□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 YOL019WYOL019W 1656 nt4.69□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 YER158CYER158C 1722 nt4.69□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 ACK1YDL203C 1872 nt4.69□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 UTP25YIL091C 2166 nt4.68□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 MNR2YKL064W 2910 nt4.68□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 snR55snR55 98 nt4.68□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 EAP1YKL204W 1899 nt4.68□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 RIM13YMR154C 2184 nt4.68□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 UBX7YBR273C 1311 nt4.68□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 YBR238CYBR238C 2196 nt4.67□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 YHR182WYHR182W 2358 nt4.67□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 IGO2YHR132W-A 396 nt4.67□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 HOP1YIL072W 1818 nt4.67□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 SSB2YNL209W 1842 nt4.67□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 MNT2YGL257C 1677 nt4.67□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 SRC1YML034W 2505 nt4.66□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 snR68snR68 136 nt4.66□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 RPL35AYDL191W 363 nt4.66□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 YIR040CYIR040C 333 nt4.66□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt4.66□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 RPL6BYLR448W 531 nt4.66□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt4.66□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 PIS1YPR113W 663 nt4.66□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 TCB3YML072C 4638 nt4.66□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 ORC2YBR060C 1863 nt4.65□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 POL1YNL102W 4407 nt4.65□□□□□ -1.66
SRF1Q12516 YGR242WYGR242W 309 nt4.65□□□□□ -1.67
SRF1Q12516 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt4.65□□□□□ -1.67
SRF1Q12516 YPR136CYPR136C 513 nt4.65□□□□□ -1.67
SRF1Q12516 PDR5YOR153W 4536 nt4.65□□□□□ -1.67
SRF1Q12516 RAD16YBR114W 2373 nt4.65□□□□□ -1.67
SRF1Q12516 YCK2YNL154C 1641 nt4.64□□□□□ -1.67
SRF1Q12516 VTC1YER072W 390 nt4.64□□□□□ -1.67
SRF1Q12516 YOR050CYOR050C 348 nt4.64□□□□□ -1.67
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