Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 snR54snR54 86 nt3.1□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 VBA4YDR119W 2307 nt3.1□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 PPN1YDR452W 2025 nt3.1□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 POL4YCR014C 1749 nt3.1□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 MSB2YGR014W 3921 nt3.1□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 CIN1YOR349W 3045 nt3.09□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 POL3YDL102W 3294 nt3.09□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 PAM1YDR251W 2493 nt3.09□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 SHS1YDL225W 1656 nt3.09□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 RPL15AYLR029C 615 nt3.09□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 DDR48YMR173W 1293 nt3.09□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 ATX1YNL259C 222 nt3.09□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 RPS7AYOR096W 573 nt3.09□□□□□ -1.91 RIP-Chip
PUF2Q12221 YOR331CYOR331C 558 nt3.09□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 SIZ1YDR409W 2715 nt3.09□□□□□ -1.92 RIP-Chip
PUF2Q12221 BRE5YNR051C 1548 nt3.09□□□□□ -1.92 RIP-Chip
PUF2Q12221 SSE2YBR169C 2082 nt3.08□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 YDL180WYDL180W 1644 nt3.08□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 PHO81YGR233C 3537 nt3.08□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 PES4YFR023W 1836 nt3.08□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 FMN1YDR236C 657 nt3.08□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 YER135CYER135C 393 nt3.08□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 MBB1YJL199C 327 nt3.08□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 RPS28BYLR264W 204 nt3.08□□□□□ -1.92 RIP-Chip
PUF2Q12221 YML108WYML108W 318 nt3.08□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 TIF11YMR260C 462 nt3.08□□□□□ -1.92 RIP-Chip
PUF2Q12221 NGL1YOL042W 1092 nt3.08□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 YPR096CYPR096C 303 nt3.08□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 AIM4YBR194W 372 nt3.08□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 MUB1YMR100W 1863 nt3.07□□□□□ -1.92 RIP-Chip
PUF2Q12221 HEH2YDR458C 1992 nt3.07□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 REG1YDR028C 3045 nt3.07□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 YKL222CYKL222C 2118 nt3.07□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 YDL242WYDL242W 354 nt3.07□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 MRH1YDR033W 963 nt3.07□□□□□ -1.92 RIP-Chip
PUF2Q12221 YDR537CYDR537C 606 nt3.07□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 YFR054CYFR054C 579 nt3.07□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 MVB12YGR206W 306 nt3.07□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 YJL086CYJL086C 369 nt3.07□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt3.07□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 SEC22YLR268W 645 nt3.07□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 RPS16AYMR143W 432 nt3.07□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 YNL089CYNL089C 477 nt3.07□□□□□ -1.92 RIP-Chip
PUF2Q12221 YME2YMR302C 2553 nt3.07□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 JIP5YPR169W 1479 nt3.07□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 STI1YOR027W 1770 nt3.07□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 PEX5YDR244W 1839 nt3.07□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 ENA2YDR039C 3276 nt3.06□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 ENA1YDR040C 3276 nt3.06□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 YER006C-AYER006C-A 318 nt3.06□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 AIM11YER093C-A 414 nt3.06□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 MIC19YFR011C 513 nt3.06□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 RPL11BYGR085C 525 nt3.06□□□□□ -1.92 RIP-Chip
PUF2Q12221 BIG1YHR101C 1008 nt3.06□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 DAS1YJL149W 1992 nt3.06□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt3.06□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 YLR076CYLR076C 423 nt3.06□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 COA4YLR218C 453 nt3.06□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 PDP3YLR455W 915 nt3.06□□□□□ -1.92 RIP-Chip
PUF2Q12221 CMC2YBL059C-A 330 nt3.06□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 YOR053WYOR053W 342 nt3.06□□□□□ -1.92 RIP-Chip
PUF2Q12221 YOR105WYOR105W 327 nt3.06□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 YOR277CYOR277C 309 nt3.06□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 RPL11AYPR102C 525 nt3.06□□□□□ -1.92 RIP-Chip
PUF2Q12221 YSY6YBR162W-A 198 nt3.06□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 MSH2YOL090W 2895 nt3.06□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 CHS2YBR038W 2892 nt3.05□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 IRC2YDR112W 309 nt3.05□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 SWF1YDR126W 1011 nt3.05□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 HMF1YER057C 390 nt3.05□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 ERV1YGR029W 570 nt3.05□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 RPL8BYLL045C 771 nt3.05□□□□□ -1.92 RIP-Chip
PUF2Q12221 YLR287CYLR287C 1068 nt3.05□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 DYN3YMR299C 939 nt3.05□□□□□ -1.92 RIP-Chip
PUF2Q12221 RIO2YNL207W 1278 nt3.05□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 PDR17YNL264C 1053 nt3.05□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 YOL150CYOL150C 312 nt3.05□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 YBR051WYBR051W 351 nt3.05□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 MYO5YMR109W 3660 nt3.05□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 ECM21YBL101C 3354 nt3.05□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt3.04□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 HAA1YPR008W 2085 nt3.04□□□□□ -1.92 RIP-Chip
PUF2Q12221 TLC1TLC1 1301 nt3.04□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 YER068C-AYER068C-A 432 nt3.04□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 PET54YGR222W 882 nt3.04□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt3.04□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 YOR199WYOR199W 330 nt3.04□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 YBR285WYBR285W 435 nt3.04□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 LCB4YOR171C 1875 nt3.04□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 RED1YLR263W 2484 nt3.03□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 RRI2YOL117W 1938 nt3.03□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 AHC2YCR082W 387 nt3.03□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 RTT105YER104W 627 nt3.03□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 YGL015CYGL015C 393 nt3.03□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 RTT102YGR275W 474 nt3.03□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 RPS20YHL015W 366 nt3.03□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt3.03□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 MDV1YJL112W 2145 nt3.03□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt3.03□□□□□ -1.92
PUF2Q12221 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt3.03□□□□□ -1.92
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