Protein–RNA interactions for Protein: Q02209

YKR011C, Uncharacterized protein YKR011C, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR011CQ02209 SIP18YMR175W 240 nt3.55□□□□□ -1.84
YKR011CQ02209 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt3.55□□□□□ -1.84
YKR011CQ02209 YPL039WYPL039W 951 nt3.55□□□□□ -1.84
YKR011CQ02209 YPR059CYPR059C 387 nt3.55□□□□□ -1.84
YKR011CQ02209 MLH2YLR035C 2088 nt3.55□□□□□ -1.84
YKR011CQ02209 JJJ2YJL162C 1752 nt3.54□□□□□ -1.84
YKR011CQ02209 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt3.54□□□□□ -1.84
YKR011CQ02209 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt3.54□□□□□ -1.84
YKR011CQ02209 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt3.54□□□□□ -1.84
YKR011CQ02209 RPL1BYGL135W 654 nt3.54□□□□□ -1.84
YKR011CQ02209 YHL037CYHL037C 402 nt3.54□□□□□ -1.84
YKR011CQ02209 FYV4YHR059W 393 nt3.54□□□□□ -1.84
YKR011CQ02209 LSM2YBL026W 288 nt3.54□□□□□ -1.84
YKR011CQ02209 TVP18YMR071C 504 nt3.54□□□□□ -1.84
YKR011CQ02209 RPL1AYPL220W 654 nt3.54□□□□□ -1.84
YKR011CQ02209 YPR039WYPR039W 336 nt3.54□□□□□ -1.84
YKR011CQ02209 KIP3YGL216W 2418 nt3.54□□□□□ -1.84
YKR011CQ02209 ALY1YKR021W 2748 nt3.54□□□□□ -1.84
YKR011CQ02209 YLR001CYLR001C 2589 nt3.54□□□□□ -1.84
YKR011CQ02209 SPT23YKL020C 3249 nt3.53□□□□□ -1.84
YKR011CQ02209 YDL176WYDL176W 2127 nt3.53□□□□□ -1.84
YKR011CQ02209 TCO89YPL180W 2400 nt3.53□□□□□ -1.84
YKR011CQ02209 ERG5YMR015C 1617 nt3.53□□□□□ -1.84
YKR011CQ02209 YDL152WYDL152W 366 nt3.53□□□□□ -1.84
YKR011CQ02209 RRT13YER066W 558 nt3.53□□□□□ -1.84
YKR011CQ02209 YOR385WYOR385W 873 nt3.53□□□□□ -1.84
YKR011CQ02209 NIC96YFR002W 2520 nt3.53□□□□□ -1.84
YKR011CQ02209 HOS3YPL116W 2094 nt3.53□□□□□ -1.84
YKR011CQ02209 BAR1YIL015W 1764 nt3.53□□□□□ -1.84
YKR011CQ02209 UBP5YER144C 2418 nt3.52□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 KIN4YOR233W 2403 nt3.52□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 CWH43YCR017C 2862 nt3.52□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 RPL29YFR032C-A 180 nt3.52□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 YGR025WYGR025W 303 nt3.52□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt3.52□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 SRL3YKR091W 741 nt3.52□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 YAR068WYAR068W 486 nt3.52□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 snR13snR13 124 nt3.52□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 SLP1YOR154W 1764 nt3.52□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 ARG2YJL071W 1725 nt3.52□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 USA1YML029W 2517 nt3.51□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 MES1YGR264C 2256 nt3.51□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 EMC1YCL045C 2283 nt3.51□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 MTR10YOR160W 2919 nt3.51□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 TAF7YMR227C 1773 nt3.51□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 YDL068WYDL068W 330 nt3.51□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 YIL054WYIL054W 318 nt3.51□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt3.51□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 VTI1YMR197C 654 nt3.51□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 RPL23AYBL087C 414 nt3.51□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 DGK1YOR311C 873 nt3.51□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 YPR053CYPR053C 456 nt3.51□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 PMT6YGR199W 2280 nt3.51□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 CHD1YER164W 4407 nt3.5□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 LCB5YLR260W 2064 nt3.5□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 GRS2YPR081C 1857 nt3.5□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 ATP5YDR298C 639 nt3.5□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt3.5□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 YAR053WYAR053W 297 nt3.5□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 URA10YMR271C 684 nt3.5□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 ROD1YOR018W 2514 nt3.5□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 SWH1YAR042W 3567 nt3.5□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 CIN1YOR349W 3045 nt3.5□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 MKT1YNL085W 2493 nt3.5□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 ECM16YMR128W 3804 nt3.5□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 FLO10YKR102W 3510 nt3.49□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 NHP2YDL208W 471 nt3.49□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 FMP10YER182W 735 nt3.49□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 RAD6YGL058W 519 nt3.49□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 BCD1YHR040W 1101 nt3.49□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt3.49□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 HFD1YMR110C 1599 nt3.49□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 SWI1YPL016W 3945 nt3.49□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 KIN82YCR091W 2163 nt3.49□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 ATP25YMR098C 1839 nt3.49□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 YGR237CYGR237C 2358 nt3.48□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 SSM4YIL030C 3960 nt3.48□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 FAT1YBR041W 2010 nt3.48□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 LOS1YKL205W 3303 nt3.48□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 MED1YPR070W 1701 nt3.48□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 DIE2YGR227W 1578 nt3.48□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 YDR413CYDR413C 576 nt3.48□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.48□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 YOR146WYOR146W 306 nt3.48□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 YOR282WYOR282W 321 nt3.48□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 NSL1YPL233W 651 nt3.48□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 YGL140CYGL140C 3660 nt3.48□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 KHA1YJL094C 2622 nt3.48□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 MCM7YBR202W 2538 nt3.47□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 YJR003CYJR003C 1560 nt3.47□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 URB2YJR041C 3525 nt3.47□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 CCM1YGR150C 2595 nt3.47□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 ERG28YER044C 447 nt3.47□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt3.47□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 PAU23YLR037C 375 nt3.47□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 YNL043CYNL043C 321 nt3.47□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 RPB11YOL005C 363 nt3.47□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 SLM6YBR266C 453 nt3.47□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.47□□□□□ -1.85
YKR011CQ02209 TOP1YOL006C 2310 nt3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 115.3 ms