Protein–RNA interactions for Protein: Q02100

SKO1, CRE-binding bZIP protein SKO1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKO1Q02100 snR59snR59 78 nt2.63□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 snR9snR9 187 nt2.63□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 FIN1YDR130C 876 nt2.63□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.63□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 YJR087WYJR087W 351 nt2.63□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 YLR224WYLR224W 1110 nt2.63□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 CSM4YPL200W 471 nt2.63□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 YPR203WYPR203W 309 nt2.63□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 YRR1YOR162C 2433 nt2.63□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 SPB1YCL054W 2526 nt2.62□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 RPS26BYER131W 360 nt2.62□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 YIP5YGL161C 933 nt2.62□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 YGR242WYGR242W 309 nt2.62□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 ACF4YJR083C 930 nt2.62□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 ATG38YLR211C 681 nt2.62□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 YNL150WYNL150W 408 nt2.62□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 BUD21YOR078W 645 nt2.62□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 SHE4YOR035C 2370 nt2.62□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 COG3YER157W 2406 nt2.62□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 POM152YMR129W 4014 nt2.62□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 JSN1YJR091C 3276 nt2.62□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.61□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 FIR1YER032W 2631 nt2.61□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 PAM1YDR251W 2493 nt2.61□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 NEL1YHR035W 1893 nt2.61□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 JIP5YPR169W 1479 nt2.61□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 YDR018CYDR018C 1191 nt2.61□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 NCB2YDR397C 441 nt2.61□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 YGR107WYGR107W 450 nt2.61□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 PEX18YHR160C 852 nt2.61□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 PHD1YKL043W 1101 nt2.61□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 COA4YLR218C 453 nt2.61□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.61□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 YAP7YOL028C 738 nt2.61□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 CYR1YJL005W 6081 nt2.61□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 CHO2YGR157W 2610 nt2.61□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 STD1YOR047C 1335 nt2.61□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 ATG13YPR185W 2217 nt2.61□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 MES1YGR264C 2256 nt2.61□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 CEP3YMR168C 1827 nt2.61□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 DAL5YJR152W 1632 nt2.6□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 NPR3YHL023C 3441 nt2.6□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 SIP3YNL257C 3690 nt2.6□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 CWC22YGR278W 1734 nt2.6□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 UBC5YDR059C 447 nt2.6□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 PRP38YGR075C 729 nt2.6□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 RTS3YGR161C 792 nt2.6□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 SDL1YIL167W 633 nt2.6□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 MBB1YJL199C 327 nt2.6□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 ATP18YML081C-A 180 nt2.6□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 YMR187CYMR187C 1296 nt2.6□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 ESF2YNR054C 951 nt2.6□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 MIX23YBL107C 591 nt2.6□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 PMR1YGL167C 2853 nt2.6□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 RGC1YPR115W 3252 nt2.6□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 GEA1YJR031C 4227 nt2.6□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 SWR1YDR334W 4545 nt2.6□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 BPT1YLL015W 4680 nt2.59□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 PPH3YDR075W 927 nt2.59□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 RPL27AYHR010W 411 nt2.59□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 PEP12YOR036W 867 nt2.59□□□□□ -1.99
SKO1Q02100 TFC4YGR047C 3078 nt2.59□□□□□ -2
SKO1Q02100 RLF2YPR018W 1821 nt2.58□□□□□ -2
SKO1Q02100 FLO5YHR211W 3228 nt2.58□□□□□ -2
SKO1Q02100 MRH1YDR033W 963 nt2.58□□□□□ -2
SKO1Q02100 VMA21YGR105W 234 nt2.58□□□□□ -2
SKO1Q02100 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.58□□□□□ -2
SKO1Q02100 NOP19YGR251W 591 nt2.58□□□□□ -2
SKO1Q02100 VID24YBR105C 1089 nt2.58□□□□□ -2
SKO1Q02100 SUL1YBR294W 2580 nt2.58□□□□□ -2
SKO1Q02100 GAL80YML051W 1308 nt2.58□□□□□ -2
SKO1Q02100 PUF4YGL014W 2667 nt2.58□□□□□ -2
SKO1Q02100 UTP14YML093W 2700 nt2.58□□□□□ -2
SKO1Q02100 SKP2YNL311C 2292 nt2.58□□□□□ -2
SKO1Q02100 POL3YDL102W 3294 nt2.58□□□□□ -2
SKO1Q02100 NMD2YHR077C 3270 nt2.58□□□□□ -2
SKO1Q02100 DNL4YOR005C 2835 nt2.57□□□□□ -2
SKO1Q02100 YBT1YLL048C 4986 nt2.57□□□□□ -2
SKO1Q02100 OCA6YDR067C 675 nt2.57□□□□□ -2
SKO1Q02100 VPS74YDR372C 1038 nt2.57□□□□□ -2
SKO1Q02100 YDR537CYDR537C 606 nt2.57□□□□□ -2
SKO1Q02100 YGR228WYGR228W 345 nt2.57□□□□□ -2
SKO1Q02100 SKT5YBL061C 2091 nt2.57□□□□□ -2
SKO1Q02100 UBP16YPL072W 1500 nt2.57□□□□□ -2
SKO1Q02100 NPR1YNL183C 2373 nt2.57□□□□□ -2
SKO1Q02100 IRA2YOL081W 9240 nt2.56□□□□□ -2
SKO1Q02100 GCV2YMR189W 3105 nt2.56□□□□□ -2
SKO1Q02100 SSN2YDR443C 4263 nt2.56□□□□□ -2
SKO1Q02100 ECM21YBL101C 3354 nt2.56□□□□□ -2
SKO1Q02100 IRC2YDR112W 309 nt2.56□□□□□ -2
SKO1Q02100 TIF35YDR429C 825 nt2.56□□□□□ -2
SKO1Q02100 FYV4YHR059W 393 nt2.56□□□□□ -2
SKO1Q02100 YAP5YIR018W 738 nt2.56□□□□□ -2
SKO1Q02100 PAU23YLR037C 375 nt2.56□□□□□ -2
SKO1Q02100 TAP42YMR028W 1101 nt2.56□□□□□ -2
SKO1Q02100 ERG29YMR134W 714 nt2.56□□□□□ -2
SKO1Q02100 YMR144WYMR144W 1029 nt2.56□□□□□ -2
SKO1Q02100 FPR1YNL135C 345 nt2.56□□□□□ -2
SKO1Q02100 YPR153WYPR153W 423 nt2.56□□□□□ -2
SKO1Q02100 YIL080WYIL080W 4722 nt2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.1 ms