Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPB1P53618 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPB1P53618 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPB1P53618 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPB1P53618 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
COPB1P53618 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPB1P53618 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COPB1P53618 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPB1P53618 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPB1P53618 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPB1P53618 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPB1P53618 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPB1P53618 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COPB1P53618 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COPB1P53618 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPB1P53618 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPB1P53618 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPB1P53618 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPB1P53618 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPB1P53618 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPB1P53618 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPB1P53618 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB1P53618 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB1P53618 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB1P53618 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB1P53618 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB1P53618 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB1P53618 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB1P53618 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB1P53618 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB1P53618 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB1P53618 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB1P53618 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB1P53618 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB1P53618 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB1P53618 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB1P53618 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB1P53618 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB1P53618 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB1P53618 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB1P53618 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB1P53618 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB1P53618 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB1P53618 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB1P53618 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB1P53618 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB1P53618 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB1P53618 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB1P53618 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB1P53618 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB1P53618 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB1P53618 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB1P53618 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB1P53618 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB1P53618 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB1P53618 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB1P53618 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB1P53618 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB1P53618 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB1P53618 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB1P53618 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB1P53618 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB1P53618 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB1P53618 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB1P53618 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB1P53618 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB1P53618 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB1P53618 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB1P53618 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB1P53618 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB1P53618 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB1P53618 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB1P53618 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB1P53618 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB1P53618 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB1P53618 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB1P53618 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB1P53618 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB1P53618 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB1P53618 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB1P53618 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB1P53618 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB1P53618 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB1P53618 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB1P53618 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB1P53618 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB1P53618 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB1P53618 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB1P53618 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPB1P53618 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPB1P53618 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPB1P53618 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPB1P53618 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COPB1P53618 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPB1P53618 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPB1P53618 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COPB1P53618 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COPB1P53618 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPB1P53618 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPB1P53618 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms