Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHKA1P46020 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 293.6 ms