Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LAD1O00515 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LAD1O00515 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAD1O00515 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAD1O00515 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAD1O00515 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LAD1O00515 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAD1O00515 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAD1O00515 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAD1O00515 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAD1O00515 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAD1O00515 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAD1O00515 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LAD1O00515 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAD1O00515 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAD1O00515 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAD1O00515 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAD1O00515 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAD1O00515 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAD1O00515 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAD1O00515 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LAD1O00515 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAD1O00515 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAD1O00515 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAD1O00515 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAD1O00515 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAD1O00515 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LAD1O00515 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LAD1O00515 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAD1O00515 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAD1O00515 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAD1O00515 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAD1O00515 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAD1O00515 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAD1O00515 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAD1O00515 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LAD1O00515 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAD1O00515 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAD1O00515 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAD1O00515 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAD1O00515 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAD1O00515 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAD1O00515 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAD1O00515 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAD1O00515 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAD1O00515 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAD1O00515 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAD1O00515 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAD1O00515 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LAD1O00515 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAD1O00515 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAD1O00515 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAD1O00515 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAD1O00515 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAD1O00515 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAD1O00515 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAD1O00515 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAD1O00515 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAD1O00515 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAD1O00515 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAD1O00515 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAD1O00515 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAD1O00515 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAD1O00515 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAD1O00515 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAD1O00515 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAD1O00515 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAD1O00515 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAD1O00515 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAD1O00515 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAD1O00515 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAD1O00515 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAD1O00515 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAD1O00515 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAD1O00515 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAD1O00515 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAD1O00515 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAD1O00515 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LAD1O00515 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LAD1O00515 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAD1O00515 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAD1O00515 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAD1O00515 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAD1O00515 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAD1O00515 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAD1O00515 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAD1O00515 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAD1O00515 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAD1O00515 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAD1O00515 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAD1O00515 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAD1O00515 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAD1O00515 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAD1O00515 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAD1O00515 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAD1O00515 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LAD1O00515 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAD1O00515 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAD1O00515 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAD1O00515 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms