Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
ARID3CA6NKF2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ARID3CA6NKF2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms