Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms