Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC78A2IDD5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC78A2IDD5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.1 ms