Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms