Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
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