Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAF1CQ15572 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
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