Protein–RNA interactions for Protein: Q04299

YMR087W, Probable ADP-ribose 1''-phosphate phosphatase YML087W, yeastyeast

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR087WQ04299 RIM9YMR063W 720 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR087WQ04299 YNL324WYNL324W 396 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR087WQ04299 RPL20BYOR312C 519 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR087WQ04299 SRB4YER022W 2064 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR087WQ04299 PDS5YMR076C 3834 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR087WQ04299 RRI2YOL117W 1938 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR087WQ04299 BNI4YNL233W 2679 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR087WQ04299 HMLALPHA2YCL067C 633 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR087WQ04299 MATALPHA2YCR039C 633 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR087WQ04299 SNA4YDL123W 423 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR087WQ04299 RSM24YDR175C 960 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR087WQ04299 EMI1YDR512C 564 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR087WQ04299 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR087WQ04299 VPS51YKR020W 495 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR087WQ04299 AFB1YLR040C 675 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR087WQ04299 ARC18YLR370C 537 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR087WQ04299 IMP4YNL075W 873 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR087WQ04299 PDR17YNL264C 1053 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR087WQ04299 PHR1YOR386W 1698 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR087WQ04299 YEL1YBL060W 2064 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR087WQ04299 TOM70YNL121C 1854 nt2.84□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 FAR1YJL157C 2493 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 ICR1ICR1 3199 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 AKR1YDR264C 2295 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 snR56snR56 88 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 VEL1YGL258W 621 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 YOR331CYOR331C 558 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 SIN3YOL004W 4611 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 RGL1YPL066W 1440 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 SNU56YDR240C 1479 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 UTP15YMR093W 1542 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 EXO84YBR102C 2262 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 TMA64YDR117C 1698 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 CDH1YGL003C 1701 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 RPL9AYGL147C 576 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 Q0142Q0142 177 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 MTM1YGR257C 1101 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 YHR130CYHR130C 336 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 YJL169WYJL169W 369 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 YKL222CYKL222C 2118 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 ILV5YLR355C 1188 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 MRPL44YMR225C 297 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 YOR277CYOR277C 309 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 NTC20YBR188C 423 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 YAK1YJL141C 2424 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 YNL193WYNL193W 1677 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 MDM1YML104C 3384 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 GCD6YDR211W 2139 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 RIX1YHR197W 2292 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 OPI6YDL096C 327 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 YER165C-AYER165C-A 357 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 RSR1YGR152C 819 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 SPO13YHR014W 876 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 YIR020CYIR020C 303 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 SYM1YLR251W 594 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 RPS28BYLR264W 204 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 CWC24YLR323C 780 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 BUD4YJR092W 4344 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 JJJ2YJL162C 1752 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 FUN30YAL019W 3396 nt2.8□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 NMD2YHR077C 3270 nt2.8□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 DOA4YDR069C 2781 nt2.8□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 UBP14YBR058C 2346 nt2.8□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 DIA2YOR080W 2199 nt2.8□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 ATP22YDR350C 2055 nt2.8□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 CBP2YHL038C 1893 nt2.8□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 FLO1YAR050W 4614 nt2.8□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt2.8□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 NSA2YER126C 786 nt2.8□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 SDO1YLR022C 753 nt2.8□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 COX8YLR395C 237 nt2.8□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 ADI1YMR009W 540 nt2.8□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt2.8□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 RRT16YNL105W 429 nt2.8□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.8□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 SVS1YPL163C 783 nt2.8□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 DUF1YOL087C 3351 nt2.8□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 BCH1YMR237W 2175 nt2.8□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 PMR1YGL167C 2853 nt2.79□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 KHA1YJL094C 2622 nt2.79□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 HFD1YMR110C 1599 nt2.79□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 ADY4YLR227C 1482 nt2.79□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 SSF1YHR066W 1362 nt2.79□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 LSM8YJR022W 330 nt2.79□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 SDH3YKL141W 597 nt2.79□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 YPR096CYPR096C 303 nt2.79□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 PIS1YPR113W 663 nt2.79□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 TCP1YDR212W 1680 nt2.79□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 DBF20YPR111W 1695 nt2.79□□□□□ -1.96
YMR087WQ04299 STP2YHR006W 1626 nt2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 101.5 ms