Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMS1P54277 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMS1P54277 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PMS1P54277 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PMS1P54277 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PMS1P54277 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PMS1P54277 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PMS1P54277 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMS1P54277 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMS1P54277 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMS1P54277 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMS1P54277 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMS1P54277 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMS1P54277 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMS1P54277 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMS1P54277 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PMS1P54277 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMS1P54277 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMS1P54277 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMS1P54277 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMS1P54277 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMS1P54277 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMS1P54277 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMS1P54277 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMS1P54277 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMS1P54277 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS1P54277 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS1P54277 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS1P54277 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS1P54277 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS1P54277 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS1P54277 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS1P54277 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS1P54277 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS1P54277 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS1P54277 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS1P54277 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS1P54277 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS1P54277 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMS1P54277 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMS1P54277 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMS1P54277 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMS1P54277 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PMS1P54277 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMS1P54277 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMS1P54277 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMS1P54277 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMS1P54277 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMS1P54277 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMS1P54277 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMS1P54277 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMS1P54277 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMS1P54277 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMS1P54277 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS1P54277 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS1P54277 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS1P54277 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS1P54277 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS1P54277 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS1P54277 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS1P54277 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS1P54277 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS1P54277 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS1P54277 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS1P54277 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS1P54277 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS1P54277 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS1P54277 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS1P54277 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS1P54277 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS1P54277 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS1P54277 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS1P54277 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS1P54277 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS1P54277 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS1P54277 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS1P54277 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS1P54277 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS1P54277 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS1P54277 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS1P54277 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS1P54277 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS1P54277 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS1P54277 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS1P54277 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS1P54277 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS1P54277 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS1P54277 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS1P54277 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS1P54277 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS1P54277 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS1P54277 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS1P54277 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS1P54277 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS1P54277 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS1P54277 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS1P54277 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS1P54277 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS1P54277 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS1P54277 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms