Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAD1O00515 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAD1O00515 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAD1O00515 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAD1O00515 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAD1O00515 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAD1O00515 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAD1O00515 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAD1O00515 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAD1O00515 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAD1O00515 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAD1O00515 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAD1O00515 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAD1O00515 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAD1O00515 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAD1O00515 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAD1O00515 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAD1O00515 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAD1O00515 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LAD1O00515 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAD1O00515 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAD1O00515 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAD1O00515 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAD1O00515 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAD1O00515 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAD1O00515 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAD1O00515 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAD1O00515 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LAD1O00515 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAD1O00515 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAD1O00515 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAD1O00515 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAD1O00515 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAD1O00515 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAD1O00515 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAD1O00515 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAD1O00515 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAD1O00515 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAD1O00515 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAD1O00515 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LAD1O00515 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAD1O00515 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAD1O00515 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAD1O00515 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAD1O00515 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAD1O00515 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAD1O00515 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAD1O00515 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAD1O00515 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAD1O00515 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAD1O00515 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAD1O00515 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAD1O00515 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAD1O00515 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAD1O00515 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LAD1O00515 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAD1O00515 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAD1O00515 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAD1O00515 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAD1O00515 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAD1O00515 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAD1O00515 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAD1O00515 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAD1O00515 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAD1O00515 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAD1O00515 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LAD1O00515 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAD1O00515 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAD1O00515 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAD1O00515 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAD1O00515 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAD1O00515 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAD1O00515 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAD1O00515 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAD1O00515 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAD1O00515 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAD1O00515 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAD1O00515 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAD1O00515 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAD1O00515 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LAD1O00515 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAD1O00515 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAD1O00515 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAD1O00515 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAD1O00515 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAD1O00515 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAD1O00515 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAD1O00515 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAD1O00515 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAD1O00515 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAD1O00515 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAD1O00515 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAD1O00515 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAD1O00515 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAD1O00515 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAD1O00515 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LAD1O00515 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LAD1O00515 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAD1O00515 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LAD1O00515 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms