Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO3A2RU48 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO3A2RU48 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms