Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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