Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFDN5Q99471 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFDN5Q99471 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFDN5Q99471 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFDN5Q99471 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFDN5Q99471 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFDN5Q99471 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFDN5Q99471 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFDN5Q99471 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFDN5Q99471 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFDN5Q99471 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFDN5Q99471 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFDN5Q99471 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PFDN5Q99471 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PFDN5Q99471 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PFDN5Q99471 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PFDN5Q99471 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PFDN5Q99471 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PFDN5Q99471 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PFDN5Q99471 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PFDN5Q99471 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PFDN5Q99471 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PFDN5Q99471 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PFDN5Q99471 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PFDN5Q99471 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PFDN5Q99471 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PFDN5Q99471 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PFDN5Q99471 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PFDN5Q99471 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFDN5Q99471 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms