Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms