Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRIP3Q6Q6R5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms