Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms