Protein–RNA interactions for Protein: Q12501

TY2B-OR2, Transposon Ty2-OR2 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-OR2Q12501 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt1.76□□□□□ -2.13
TY2B-OR2Q12501 YCL019WYCL019W 5313 nt1.76□□□□□ -2.13
TY2B-OR2Q12501 NPR1YNL183C 2373 nt1.76□□□□□ -2.13
TY2B-OR2Q12501 SPH1YLR313C 1593 nt1.76□□□□□ -2.13
TY2B-OR2Q12501 YEL1YBL060W 2064 nt1.76□□□□□ -2.13
TY2B-OR2Q12501 RPN5YDL147W 1338 nt1.76□□□□□ -2.13
TY2B-OR2Q12501 CDC25YLR310C 4770 nt1.75□□□□□ -2.13
TY2B-OR2Q12501 RRP42YDL111C 798 nt1.75□□□□□ -2.13
TY2B-OR2Q12501 YGL069CYGL069C 465 nt1.75□□□□□ -2.13
TY2B-OR2Q12501 MRE11YMR224C 2079 nt1.75□□□□□ -2.13
TY2B-OR2Q12501 RRP8YDR083W 1179 nt1.75□□□□□ -2.13
TY2B-OR2Q12501 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.75□□□□□ -2.13
TY2B-OR2Q12501 HCH1YNL281W 462 nt1.75□□□□□ -2.13
TY2B-OR2Q12501 MCT1YOR221C 1083 nt1.75□□□□□ -2.13
TY2B-OR2Q12501 SPE1YKL184W 1401 nt1.74□□□□□ -2.13
TY2B-OR2Q12501 HFM1YGL251C 3564 nt1.74□□□□□ -2.13
TY2B-OR2Q12501 FRQ1YDR373W 573 nt1.74□□□□□ -2.13
TY2B-OR2Q12501 ENP2YGR145W 2124 nt1.74□□□□□ -2.13
TY2B-OR2Q12501 ISW2YOR304W 3363 nt1.73□□□□□ -2.13
TY2B-OR2Q12501 RAV2YDR202C 1056 nt1.73□□□□□ -2.13
TY2B-OR2Q12501 TIM9YEL020W-A 264 nt1.73□□□□□ -2.13
TY2B-OR2Q12501 YGL117WYGL117W 798 nt1.73□□□□□ -2.13
TY2B-OR2Q12501 VMA10YHR039C-A 345 nt1.73□□□□□ -2.13
TY2B-OR2Q12501 YHR097CYHR097C 1101 nt1.72□□□□□ -2.13
TY2B-OR2Q12501 TRM112YNR046W 408 nt1.72□□□□□ -2.13
TY2B-OR2Q12501 SLM4YBR077C 489 nt1.72□□□□□ -2.13
TY2B-OR2Q12501 YMR1YJR110W 2067 nt1.71□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 PET309YLR067C 2898 nt1.71□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 YER067C-AYER067C-A 324 nt1.71□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 MIG2YGL209W 1149 nt1.71□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 HKR1YDR420W 5409 nt1.71□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 DFG16YOR030W 1860 nt1.7□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 TCM62YBR044C 1719 nt1.7□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 RNA1YMR235C 1224 nt1.7□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 FMP16YDR070C 282 nt1.7□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 RTT105YER104W 627 nt1.7□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 BUR6YER159C 429 nt1.7□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 YGR242WYGR242W 309 nt1.7□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 NDC80YIL144W 2076 nt1.69□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 STP1YDR463W 1560 nt1.69□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 MET18YIL128W 3099 nt1.69□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt1.69□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 RPS0BYLR048W 759 nt1.69□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 SVS1YPL163C 783 nt1.69□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 YJL070CYJL070C 2667 nt1.69□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 NOP56YLR197W 1515 nt1.69□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 IST2YBR086C 2841 nt1.69□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 SEC15YGL233W 2733 nt1.68□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 CBP6YBR120C 489 nt1.68□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 UTP6YDR449C 1323 nt1.68□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 URB2YJR041C 3525 nt1.68□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 SPS2YDR522C 1509 nt1.68□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 PUF2YPR042C 3228 nt1.68□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 ARP10YDR106W 855 nt1.67□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 YDR115WYDR115W 318 nt1.67□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 PAM16YJL104W 450 nt1.67□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 PRP16YKR086W 3216 nt1.67□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 RKM1YPL208W 1752 nt1.67□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 HTD2YHR067W 843 nt1.67□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 MSL1YIR009W 336 nt1.67□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 YNL203CYNL203C 612 nt1.67□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 SRO9YCL037C 1305 nt1.67□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 UBP16YPL072W 1500 nt1.66□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 YSP1YHR155W 3687 nt1.66□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 CIK1YMR198W 1785 nt1.66□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 YGR237CYGR237C 2358 nt1.66□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 ARG2YJL071W 1725 nt1.66□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 ALE1YOR175C 1860 nt1.66□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 YBR089WYBR089W 600 nt1.65□□□□□ -2.14
TY2B-OR2Q12501 RLF2YPR018W 1821 nt1.65□□□□□ -2.15
TY2B-OR2Q12501 GAS2YLR343W 1668 nt1.65□□□□□ -2.15
TY2B-OR2Q12501 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.64□□□□□ -2.15
TY2B-OR2Q12501 YPR078CYPR078C 1119 nt1.64□□□□□ -2.15
TY2B-OR2Q12501 TAZ1YPR140W 1146 nt1.64□□□□□ -2.15
TY2B-OR2Q12501 ULP2YIL031W 3105 nt1.64□□□□□ -2.15
TY2B-OR2Q12501 ATP25YMR098C 1839 nt1.64□□□□□ -2.15
TY2B-OR2Q12501 SPP382YLR424W 2127 nt1.64□□□□□ -2.15
TY2B-OR2Q12501 MAD1YGL086W 2250 nt1.63□□□□□ -2.15
TY2B-OR2Q12501 VHR1YIL056W 1923 nt1.63□□□□□ -2.15
TY2B-OR2Q12501 GPI17YDR434W 1605 nt1.63□□□□□ -2.15
TY2B-OR2Q12501 SCC2YDR180W 4482 nt1.63□□□□□ -2.15
TY2B-OR2Q12501 YNL046WYNL046W 519 nt1.62□□□□□ -2.15
TY2B-OR2Q12501 ATX2YOR079C 942 nt1.62□□□□□ -2.15
TY2B-OR2Q12501 PHO5YBR093C 1404 nt1.62□□□□□ -2.15
TY2B-OR2Q12501 PRP18YGR006W 756 nt1.62□□□□□ -2.15
TY2B-OR2Q12501 HAL1YPR005C 885 nt1.62□□□□□ -2.15
TY2B-OR2Q12501 RIX1YHR197W 2292 nt1.61□□□□□ -2.15
TY2B-OR2Q12501 MYO2YOR326W 4725 nt1.61□□□□□ -2.15
TY2B-OR2Q12501 IRC6YFR043C 714 nt1.61□□□□□ -2.15
TY2B-OR2Q12501 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt1.61□□□□□ -2.15
TY2B-OR2Q12501 YLR366WYLR366W 306 nt1.61□□□□□ -2.15
TY2B-OR2Q12501 YMR321CYMR321C 318 nt1.61□□□□□ -2.15
TY2B-OR2Q12501 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.61□□□□□ -2.15
TY2B-OR2Q12501 PTC5YOR090C 1719 nt1.61□□□□□ -2.15
TY2B-OR2Q12501 RLP24YLR009W 600 nt1.6□□□□□ -2.15
TY2B-OR2Q12501 FMC1YIL098C 468 nt1.59□□□□□ -2.15
TY2B-OR2Q12501 YJL119CYJL119C 324 nt1.59□□□□□ -2.15
TY2B-OR2Q12501 YPL071CYPL071C 471 nt1.59□□□□□ -2.15
TY2B-OR2Q12501 VMR1YHL035C 4779 nt1.59□□□□□ -2.15
TY2B-OR2Q12501 UTP25YIL091C 2166 nt1.59□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.3 ms