Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms