Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms