Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEFF2Q9UIK5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEFF2Q9UIK5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEFF2Q9UIK5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEFF2Q9UIK5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEFF2Q9UIK5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEFF2Q9UIK5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEFF2Q9UIK5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEFF2Q9UIK5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEFF2Q9UIK5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEFF2Q9UIK5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEFF2Q9UIK5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEFF2Q9UIK5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms