Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms