Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q3C1V9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q3C1V9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q3C1V9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q3C1V9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q3C1V9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q3C1V9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q3C1V9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q3C1V9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q3C1V9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q3C1V9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q3C1V9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q3C1V9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q3C1V9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q3C1V9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q3C1V9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q3C1V9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q3C1V9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q3C1V9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q3C1V9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q3C1V9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q3C1V9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q3C1V9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q3C1V9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q3C1V9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Q3C1V9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q3C1V9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Q3C1V9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q3C1V9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q3C1V9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q3C1V9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q3C1V9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q3C1V9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q3C1V9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q3C1V9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q3C1V9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q3C1V9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Q3C1V9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q3C1V9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Q3C1V9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q3C1V9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q3C1V9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q3C1V9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q3C1V9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q3C1V9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q3C1V9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q3C1V9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q3C1V9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q3C1V9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q3C1V9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q3C1V9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q3C1V9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q3C1V9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Q3C1V9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q3C1V9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q3C1V9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q3C1V9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q3C1V9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q3C1V9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q3C1V9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q3C1V9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Q3C1V9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Q3C1V9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q3C1V9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q3C1V9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q3C1V9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q3C1V9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q3C1V9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q3C1V9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q3C1V9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q3C1V9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q3C1V9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q3C1V9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q3C1V9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q3C1V9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q3C1V9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q3C1V9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q3C1V9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q3C1V9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q3C1V9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q3C1V9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Q3C1V9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q3C1V9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q3C1V9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q3C1V9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Q3C1V9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q3C1V9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q3C1V9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Q3C1V9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q3C1V9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q3C1V9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q3C1V9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q3C1V9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q3C1V9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q3C1V9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q3C1V9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q3C1V9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q3C1V9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q3C1V9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q3C1V9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms