Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD1Q15797 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMAD1Q15797 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SMAD1Q15797 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SMAD1Q15797 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMAD1Q15797 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SMAD1Q15797 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD1Q15797 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD1Q15797 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD1Q15797 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD1Q15797 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD1Q15797 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD1Q15797 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD1Q15797 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD1Q15797 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD1Q15797 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMAD1Q15797 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD1Q15797 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD1Q15797 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD1Q15797 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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